Protein–RNA interactions for Protein: P53657

Pklr, Pyruvate kinase PKLR, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PklrP53657 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PklrP53657 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PklrP53657 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PklrP53657 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PklrP53657 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PklrP53657 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PklrP53657 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PklrP53657 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PklrP53657 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PklrP53657 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PklrP53657 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PklrP53657 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PklrP53657 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PklrP53657 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PklrP53657 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PklrP53657 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PklrP53657 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PklrP53657 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PklrP53657 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PklrP53657 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PklrP53657 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PklrP53657 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PklrP53657 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PklrP53657 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PklrP53657 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PklrP53657 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PklrP53657 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PklrP53657 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PklrP53657 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PklrP53657 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
PklrP53657 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PklrP53657 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PklrP53657 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PklrP53657 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PklrP53657 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PklrP53657 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PklrP53657 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PklrP53657 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PklrP53657 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PklrP53657 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PklrP53657 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PklrP53657 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PklrP53657 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PklrP53657 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PklrP53657 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PklrP53657 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PklrP53657 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PklrP53657 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PklrP53657 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PklrP53657 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PklrP53657 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PklrP53657 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PklrP53657 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PklrP53657 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PklrP53657 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PklrP53657 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PklrP53657 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PklrP53657 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PklrP53657 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PklrP53657 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PklrP53657 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PklrP53657 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PklrP53657 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PklrP53657 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PklrP53657 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PklrP53657 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PklrP53657 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PklrP53657 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PklrP53657 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PklrP53657 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PklrP53657 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PklrP53657 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PklrP53657 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PklrP53657 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PklrP53657 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PklrP53657 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PklrP53657 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PklrP53657 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PklrP53657 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PklrP53657 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PklrP53657 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PklrP53657 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PklrP53657 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PklrP53657 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PklrP53657 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PklrP53657 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PklrP53657 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
PklrP53657 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PklrP53657 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PklrP53657 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PklrP53657 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PklrP53657 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PklrP53657 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PklrP53657 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PklrP53657 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PklrP53657 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PklrP53657 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PklrP53657 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PklrP53657 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
PklrP53657 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70 ms