Protein–RNA interactions for Protein: P52795

Efnb1, Ephrin-B1, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efnb1P52795 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Efnb1P52795 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Efnb1P52795 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Efnb1P52795 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Efnb1P52795 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Efnb1P52795 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Efnb1P52795 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Efnb1P52795 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Efnb1P52795 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Efnb1P52795 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Efnb1P52795 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Efnb1P52795 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Efnb1P52795 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Efnb1P52795 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Efnb1P52795 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Efnb1P52795 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Efnb1P52795 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Efnb1P52795 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Efnb1P52795 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Efnb1P52795 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Efnb1P52795 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Efnb1P52795 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Efnb1P52795 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Efnb1P52795 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Efnb1P52795 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Efnb1P52795 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Efnb1P52795 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Efnb1P52795 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Efnb1P52795 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Efnb1P52795 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Efnb1P52795 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Efnb1P52795 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Efnb1P52795 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Efnb1P52795 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Efnb1P52795 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Efnb1P52795 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Efnb1P52795 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Efnb1P52795 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Efnb1P52795 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Efnb1P52795 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Efnb1P52795 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Efnb1P52795 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Efnb1P52795 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Efnb1P52795 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Efnb1P52795 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Efnb1P52795 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Efnb1P52795 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Efnb1P52795 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Efnb1P52795 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Efnb1P52795 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Efnb1P52795 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Efnb1P52795 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Efnb1P52795 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Efnb1P52795 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Efnb1P52795 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Efnb1P52795 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Efnb1P52795 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Efnb1P52795 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Efnb1P52795 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Efnb1P52795 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Efnb1P52795 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Efnb1P52795 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Efnb1P52795 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Efnb1P52795 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Efnb1P52795 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Efnb1P52795 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Efnb1P52795 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Efnb1P52795 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Efnb1P52795 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Efnb1P52795 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Efnb1P52795 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Efnb1P52795 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Efnb1P52795 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Efnb1P52795 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Efnb1P52795 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Efnb1P52795 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Efnb1P52795 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Efnb1P52795 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Efnb1P52795 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Efnb1P52795 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Efnb1P52795 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Efnb1P52795 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Efnb1P52795 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Efnb1P52795 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Efnb1P52795 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Efnb1P52795 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Efnb1P52795 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Efnb1P52795 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Efnb1P52795 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Efnb1P52795 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Efnb1P52795 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Efnb1P52795 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Efnb1P52795 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Efnb1P52795 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Efnb1P52795 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Efnb1P52795 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Efnb1P52795 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Efnb1P52795 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Efnb1P52795 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Efnb1P52795 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms