Protein–RNA interactions for Protein: P52624

Upp1, Uridine phosphorylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp1P52624 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Upp1P52624 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Upp1P52624 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Upp1P52624 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Upp1P52624 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Upp1P52624 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Upp1P52624 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Upp1P52624 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Upp1P52624 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Upp1P52624 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Upp1P52624 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Upp1P52624 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Upp1P52624 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Upp1P52624 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Upp1P52624 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Upp1P52624 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Upp1P52624 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Upp1P52624 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Upp1P52624 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Upp1P52624 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Upp1P52624 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Upp1P52624 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Upp1P52624 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Upp1P52624 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Upp1P52624 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Upp1P52624 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Upp1P52624 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Upp1P52624 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Upp1P52624 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Upp1P52624 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Upp1P52624 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Upp1P52624 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Upp1P52624 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Upp1P52624 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Upp1P52624 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Upp1P52624 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Upp1P52624 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Upp1P52624 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Upp1P52624 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Upp1P52624 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Upp1P52624 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Upp1P52624 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Upp1P52624 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Upp1P52624 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Upp1P52624 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Upp1P52624 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Upp1P52624 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Upp1P52624 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Upp1P52624 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Upp1P52624 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Upp1P52624 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Upp1P52624 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Upp1P52624 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Upp1P52624 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Upp1P52624 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Upp1P52624 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Upp1P52624 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Upp1P52624 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Upp1P52624 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Upp1P52624 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Upp1P52624 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Upp1P52624 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Upp1P52624 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Upp1P52624 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Upp1P52624 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Upp1P52624 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Upp1P52624 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Upp1P52624 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Upp1P52624 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Upp1P52624 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Upp1P52624 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Upp1P52624 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Upp1P52624 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Upp1P52624 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Upp1P52624 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Upp1P52624 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Upp1P52624 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Upp1P52624 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Upp1P52624 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Upp1P52624 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Upp1P52624 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Upp1P52624 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Upp1P52624 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Upp1P52624 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Upp1P52624 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Upp1P52624 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Upp1P52624 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Upp1P52624 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Upp1P52624 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Upp1P52624 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Upp1P52624 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Upp1P52624 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Upp1P52624 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Upp1P52624 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Upp1P52624 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Upp1P52624 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Upp1P52624 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Upp1P52624 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Upp1P52624 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Upp1P52624 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms