Protein–RNA interactions for Protein: P50716

Defa-rs12, Alpha-defensin-related sequence 12, mousemouse

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs12P50716 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Defa-rs12P50716 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Defa-rs12P50716 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Defa-rs12P50716 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Defa-rs12P50716 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Defa-rs12P50716 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Defa-rs12P50716 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Defa-rs12P50716 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Defa-rs12P50716 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Defa-rs12P50716 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Defa-rs12P50716 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Defa-rs12P50716 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Defa-rs12P50716 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Defa-rs12P50716 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Defa-rs12P50716 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Defa-rs12P50716 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Defa-rs12P50716 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Defa-rs12P50716 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Defa-rs12P50716 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Defa-rs12P50716 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Defa-rs12P50716 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Defa-rs12P50716 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Defa-rs12P50716 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Defa-rs12P50716 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Defa-rs12P50716 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Defa-rs12P50716 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Defa-rs12P50716 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Defa-rs12P50716 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Defa-rs12P50716 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Defa-rs12P50716 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Defa-rs12P50716 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Defa-rs12P50716 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Defa-rs12P50716 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Defa-rs12P50716 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Defa-rs12P50716 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Defa-rs12P50716 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Defa-rs12P50716 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Defa-rs12P50716 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Defa-rs12P50716 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Defa-rs12P50716 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Defa-rs12P50716 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Defa-rs12P50716 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Defa-rs12P50716 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Defa-rs12P50716 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Defa-rs12P50716 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Defa-rs12P50716 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Defa-rs12P50716 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Defa-rs12P50716 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Defa-rs12P50716 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Defa-rs12P50716 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Defa-rs12P50716 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Defa-rs12P50716 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Defa-rs12P50716 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Defa-rs12P50716 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Defa-rs12P50716 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Defa-rs12P50716 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Defa-rs12P50716 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Defa-rs12P50716 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Defa-rs12P50716 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Defa-rs12P50716 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Defa-rs12P50716 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Defa-rs12P50716 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Defa-rs12P50716 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Defa-rs12P50716 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Defa-rs12P50716 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Defa-rs12P50716 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Defa-rs12P50716 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Defa-rs12P50716 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Defa-rs12P50716 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Defa-rs12P50716 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Defa-rs12P50716 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Defa-rs12P50716 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Defa-rs12P50716 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Defa-rs12P50716 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Defa-rs12P50716 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Defa-rs12P50716 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Defa-rs12P50716 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Defa-rs12P50716 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Defa-rs12P50716 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Defa-rs12P50716 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Defa-rs12P50716 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Defa-rs12P50716 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Defa-rs12P50716 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Defa-rs12P50716 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Defa-rs12P50716 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Defa-rs12P50716 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Defa-rs12P50716 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Defa-rs12P50716 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Defa-rs12P50716 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Defa-rs12P50716 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Defa-rs12P50716 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Defa-rs12P50716 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Defa-rs12P50716 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Defa-rs12P50716 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Defa-rs12P50716 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Defa-rs12P50716 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Defa-rs12P50716 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Defa-rs12P50716 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Defa-rs12P50716 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Defa-rs12P50716 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms