Protein–RNA interactions for Protein: P50284

Ltbr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, mousemouse

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbrP50284 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
LtbrP50284 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LtbrP50284 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LtbrP50284 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LtbrP50284 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LtbrP50284 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LtbrP50284 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LtbrP50284 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LtbrP50284 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LtbrP50284 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LtbrP50284 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LtbrP50284 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LtbrP50284 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LtbrP50284 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LtbrP50284 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LtbrP50284 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
LtbrP50284 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LtbrP50284 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LtbrP50284 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LtbrP50284 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LtbrP50284 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LtbrP50284 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LtbrP50284 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LtbrP50284 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LtbrP50284 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LtbrP50284 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LtbrP50284 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LtbrP50284 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LtbrP50284 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LtbrP50284 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LtbrP50284 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LtbrP50284 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LtbrP50284 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LtbrP50284 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LtbrP50284 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LtbrP50284 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LtbrP50284 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LtbrP50284 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LtbrP50284 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LtbrP50284 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LtbrP50284 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
LtbrP50284 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
LtbrP50284 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LtbrP50284 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LtbrP50284 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
LtbrP50284 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LtbrP50284 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LtbrP50284 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LtbrP50284 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LtbrP50284 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LtbrP50284 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LtbrP50284 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LtbrP50284 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LtbrP50284 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LtbrP50284 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LtbrP50284 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
LtbrP50284 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
LtbrP50284 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
LtbrP50284 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
LtbrP50284 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LtbrP50284 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LtbrP50284 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LtbrP50284 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LtbrP50284 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
LtbrP50284 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LtbrP50284 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LtbrP50284 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LtbrP50284 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LtbrP50284 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LtbrP50284 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LtbrP50284 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LtbrP50284 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LtbrP50284 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LtbrP50284 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LtbrP50284 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LtbrP50284 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LtbrP50284 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LtbrP50284 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LtbrP50284 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LtbrP50284 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LtbrP50284 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LtbrP50284 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LtbrP50284 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LtbrP50284 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LtbrP50284 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LtbrP50284 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LtbrP50284 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LtbrP50284 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LtbrP50284 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LtbrP50284 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LtbrP50284 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LtbrP50284 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LtbrP50284 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LtbrP50284 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
LtbrP50284 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LtbrP50284 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LtbrP50284 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LtbrP50284 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LtbrP50284 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LtbrP50284 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
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