Protein–RNA interactions for Protein: P50228

Cxcl5, C-X-C motif chemokine 5, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl5P50228 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cxcl5P50228 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cxcl5P50228 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cxcl5P50228 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cxcl5P50228 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cxcl5P50228 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cxcl5P50228 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cxcl5P50228 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cxcl5P50228 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cxcl5P50228 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cxcl5P50228 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cxcl5P50228 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cxcl5P50228 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cxcl5P50228 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cxcl5P50228 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cxcl5P50228 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cxcl5P50228 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cxcl5P50228 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cxcl5P50228 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cxcl5P50228 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cxcl5P50228 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cxcl5P50228 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cxcl5P50228 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cxcl5P50228 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cxcl5P50228 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cxcl5P50228 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cxcl5P50228 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cxcl5P50228 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cxcl5P50228 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cxcl5P50228 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cxcl5P50228 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cxcl5P50228 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cxcl5P50228 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cxcl5P50228 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cxcl5P50228 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cxcl5P50228 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cxcl5P50228 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cxcl5P50228 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cxcl5P50228 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cxcl5P50228 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cxcl5P50228 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cxcl5P50228 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cxcl5P50228 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cxcl5P50228 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cxcl5P50228 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cxcl5P50228 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cxcl5P50228 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cxcl5P50228 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cxcl5P50228 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cxcl5P50228 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cxcl5P50228 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cxcl5P50228 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cxcl5P50228 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cxcl5P50228 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cxcl5P50228 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cxcl5P50228 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cxcl5P50228 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cxcl5P50228 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cxcl5P50228 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cxcl5P50228 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cxcl5P50228 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cxcl5P50228 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cxcl5P50228 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cxcl5P50228 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cxcl5P50228 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cxcl5P50228 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cxcl5P50228 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cxcl5P50228 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cxcl5P50228 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cxcl5P50228 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cxcl5P50228 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cxcl5P50228 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cxcl5P50228 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cxcl5P50228 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cxcl5P50228 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cxcl5P50228 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cxcl5P50228 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cxcl5P50228 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cxcl5P50228 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cxcl5P50228 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cxcl5P50228 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cxcl5P50228 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cxcl5P50228 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cxcl5P50228 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cxcl5P50228 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cxcl5P50228 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cxcl5P50228 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cxcl5P50228 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cxcl5P50228 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cxcl5P50228 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cxcl5P50228 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cxcl5P50228 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cxcl5P50228 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cxcl5P50228 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cxcl5P50228 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cxcl5P50228 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cxcl5P50228 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cxcl5P50228 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cxcl5P50228 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cxcl5P50228 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms