Protein–RNA interactions for Protein: P48986

Neurod6, Neurogenic differentiation factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurod6P48986 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Neurod6P48986 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Neurod6P48986 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Neurod6P48986 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Neurod6P48986 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Neurod6P48986 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Neurod6P48986 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Neurod6P48986 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Neurod6P48986 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Neurod6P48986 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Neurod6P48986 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Neurod6P48986 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Neurod6P48986 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Neurod6P48986 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Neurod6P48986 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Neurod6P48986 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Neurod6P48986 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Neurod6P48986 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Neurod6P48986 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Neurod6P48986 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Neurod6P48986 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Neurod6P48986 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Neurod6P48986 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Neurod6P48986 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Neurod6P48986 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Neurod6P48986 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Neurod6P48986 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Neurod6P48986 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Neurod6P48986 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Neurod6P48986 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Neurod6P48986 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Neurod6P48986 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Neurod6P48986 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Neurod6P48986 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Neurod6P48986 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Neurod6P48986 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Neurod6P48986 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Neurod6P48986 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Neurod6P48986 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Neurod6P48986 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Neurod6P48986 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Neurod6P48986 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Neurod6P48986 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Neurod6P48986 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Neurod6P48986 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Neurod6P48986 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Neurod6P48986 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Neurod6P48986 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Neurod6P48986 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Neurod6P48986 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Neurod6P48986 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Neurod6P48986 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Neurod6P48986 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Neurod6P48986 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Neurod6P48986 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Neurod6P48986 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Neurod6P48986 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Neurod6P48986 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Neurod6P48986 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Neurod6P48986 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Neurod6P48986 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Neurod6P48986 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Neurod6P48986 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Neurod6P48986 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Neurod6P48986 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Neurod6P48986 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Neurod6P48986 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Neurod6P48986 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Neurod6P48986 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Neurod6P48986 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Neurod6P48986 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Neurod6P48986 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Neurod6P48986 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Neurod6P48986 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Neurod6P48986 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Neurod6P48986 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Neurod6P48986 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Neurod6P48986 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Neurod6P48986 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Neurod6P48986 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Neurod6P48986 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Neurod6P48986 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Neurod6P48986 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Neurod6P48986 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Neurod6P48986 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Neurod6P48986 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Neurod6P48986 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Neurod6P48986 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Neurod6P48986 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Neurod6P48986 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Neurod6P48986 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Neurod6P48986 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Neurod6P48986 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Neurod6P48986 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Neurod6P48986 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Neurod6P48986 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Neurod6P48986 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Neurod6P48986 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Neurod6P48986 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Neurod6P48986 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms