Protein–RNA interactions for Protein: P48787

Tnni3, Troponin I, cardiac muscle, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni3P48787 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnni3P48787 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnni3P48787 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnni3P48787 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnni3P48787 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnni3P48787 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnni3P48787 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnni3P48787 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnni3P48787 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnni3P48787 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnni3P48787 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnni3P48787 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnni3P48787 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tnni3P48787 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tnni3P48787 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tnni3P48787 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tnni3P48787 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Tnni3P48787 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tnni3P48787 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Tnni3P48787 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tnni3P48787 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tnni3P48787 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tnni3P48787 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tnni3P48787 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tnni3P48787 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tnni3P48787 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tnni3P48787 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tnni3P48787 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tnni3P48787 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tnni3P48787 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tnni3P48787 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Tnni3P48787 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tnni3P48787 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tnni3P48787 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tnni3P48787 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tnni3P48787 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tnni3P48787 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tnni3P48787 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tnni3P48787 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tnni3P48787 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tnni3P48787 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tnni3P48787 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tnni3P48787 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tnni3P48787 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tnni3P48787 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tnni3P48787 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tnni3P48787 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tnni3P48787 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tnni3P48787 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tnni3P48787 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tnni3P48787 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tnni3P48787 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tnni3P48787 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tnni3P48787 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tnni3P48787 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tnni3P48787 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tnni3P48787 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tnni3P48787 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tnni3P48787 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tnni3P48787 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tnni3P48787 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tnni3P48787 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tnni3P48787 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tnni3P48787 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Tnni3P48787 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Tnni3P48787 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tnni3P48787 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Tnni3P48787 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tnni3P48787 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tnni3P48787 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Tnni3P48787 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tnni3P48787 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tnni3P48787 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tnni3P48787 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tnni3P48787 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tnni3P48787 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tnni3P48787 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tnni3P48787 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tnni3P48787 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tnni3P48787 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tnni3P48787 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tnni3P48787 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tnni3P48787 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tnni3P48787 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tnni3P48787 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tnni3P48787 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tnni3P48787 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tnni3P48787 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tnni3P48787 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tnni3P48787 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tnni3P48787 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tnni3P48787 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tnni3P48787 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tnni3P48787 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tnni3P48787 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tnni3P48787 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tnni3P48787 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tnni3P48787 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tnni3P48787 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tnni3P48787 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms