Protein–RNA interactions for Protein: P48377

Rfx1, MHC class II regulatory factor RFX1, mousemouse

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx1P48377 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rfx1P48377 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rfx1P48377 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rfx1P48377 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Rfx1P48377 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rfx1P48377 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rfx1P48377 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rfx1P48377 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rfx1P48377 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rfx1P48377 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rfx1P48377 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rfx1P48377 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rfx1P48377 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Rfx1P48377 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rfx1P48377 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rfx1P48377 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rfx1P48377 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rfx1P48377 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rfx1P48377 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rfx1P48377 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rfx1P48377 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rfx1P48377 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rfx1P48377 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rfx1P48377 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rfx1P48377 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rfx1P48377 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rfx1P48377 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rfx1P48377 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rfx1P48377 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rfx1P48377 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rfx1P48377 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rfx1P48377 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rfx1P48377 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rfx1P48377 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rfx1P48377 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rfx1P48377 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rfx1P48377 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rfx1P48377 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rfx1P48377 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rfx1P48377 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rfx1P48377 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rfx1P48377 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Rfx1P48377 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rfx1P48377 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rfx1P48377 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rfx1P48377 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rfx1P48377 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rfx1P48377 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rfx1P48377 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rfx1P48377 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rfx1P48377 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rfx1P48377 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rfx1P48377 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rfx1P48377 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rfx1P48377 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rfx1P48377 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rfx1P48377 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rfx1P48377 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rfx1P48377 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rfx1P48377 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rfx1P48377 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rfx1P48377 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rfx1P48377 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rfx1P48377 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rfx1P48377 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rfx1P48377 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rfx1P48377 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rfx1P48377 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rfx1P48377 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rfx1P48377 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rfx1P48377 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rfx1P48377 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rfx1P48377 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rfx1P48377 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Rfx1P48377 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rfx1P48377 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rfx1P48377 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rfx1P48377 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rfx1P48377 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rfx1P48377 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rfx1P48377 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rfx1P48377 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rfx1P48377 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rfx1P48377 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rfx1P48377 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rfx1P48377 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rfx1P48377 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rfx1P48377 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rfx1P48377 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rfx1P48377 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rfx1P48377 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rfx1P48377 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rfx1P48377 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rfx1P48377 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rfx1P48377 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rfx1P48377 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rfx1P48377 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rfx1P48377 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rfx1P48377 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rfx1P48377 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms