Protein–RNA interactions for Protein: P47915

Rpl29, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl29P47915 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpl29P47915 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpl29P47915 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpl29P47915 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpl29P47915 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpl29P47915 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpl29P47915 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpl29P47915 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpl29P47915 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpl29P47915 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpl29P47915 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpl29P47915 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpl29P47915 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpl29P47915 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpl29P47915 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpl29P47915 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpl29P47915 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpl29P47915 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpl29P47915 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpl29P47915 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpl29P47915 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpl29P47915 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl29P47915 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl29P47915 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl29P47915 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl29P47915 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl29P47915 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl29P47915 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl29P47915 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl29P47915 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl29P47915 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl29P47915 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl29P47915 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl29P47915 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl29P47915 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl29P47915 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl29P47915 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl29P47915 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl29P47915 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl29P47915 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl29P47915 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl29P47915 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl29P47915 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl29P47915 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl29P47915 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl29P47915 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl29P47915 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl29P47915 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl29P47915 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl29P47915 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl29P47915 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl29P47915 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl29P47915 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl29P47915 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl29P47915 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl29P47915 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl29P47915 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl29P47915 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl29P47915 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl29P47915 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl29P47915 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl29P47915 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl29P47915 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl29P47915 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl29P47915 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl29P47915 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl29P47915 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl29P47915 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl29P47915 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl29P47915 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl29P47915 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl29P47915 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl29P47915 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl29P47915 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl29P47915 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl29P47915 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl29P47915 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl29P47915 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl29P47915 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl29P47915 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl29P47915 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl29P47915 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl29P47915 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl29P47915 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl29P47915 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl29P47915 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl29P47915 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl29P47915 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl29P47915 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl29P47915 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl29P47915 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl29P47915 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl29P47915 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl29P47915 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl29P47915 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl29P47915 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl29P47915 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl29P47915 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl29P47915 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl29P47915 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms