Protein–RNA interactions for Protein: P47239

Pax7, Paired box protein Pax-7, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax7P47239 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pax7P47239 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pax7P47239 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pax7P47239 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pax7P47239 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pax7P47239 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Pax7P47239 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pax7P47239 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pax7P47239 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pax7P47239 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pax7P47239 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pax7P47239 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Pax7P47239 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pax7P47239 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pax7P47239 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pax7P47239 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pax7P47239 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Pax7P47239 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Pax7P47239 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Pax7P47239 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pax7P47239 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pax7P47239 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pax7P47239 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pax7P47239 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pax7P47239 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pax7P47239 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pax7P47239 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pax7P47239 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pax7P47239 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pax7P47239 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pax7P47239 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pax7P47239 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pax7P47239 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pax7P47239 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pax7P47239 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pax7P47239 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pax7P47239 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pax7P47239 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pax7P47239 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pax7P47239 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pax7P47239 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pax7P47239 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pax7P47239 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pax7P47239 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pax7P47239 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pax7P47239 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pax7P47239 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pax7P47239 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pax7P47239 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pax7P47239 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pax7P47239 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pax7P47239 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pax7P47239 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pax7P47239 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pax7P47239 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pax7P47239 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Pax7P47239 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Pax7P47239 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pax7P47239 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pax7P47239 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pax7P47239 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pax7P47239 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pax7P47239 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pax7P47239 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pax7P47239 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pax7P47239 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Pax7P47239 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Pax7P47239 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Pax7P47239 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pax7P47239 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pax7P47239 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Pax7P47239 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pax7P47239 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Pax7P47239 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Pax7P47239 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pax7P47239 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pax7P47239 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pax7P47239 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pax7P47239 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pax7P47239 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pax7P47239 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pax7P47239 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pax7P47239 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pax7P47239 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pax7P47239 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pax7P47239 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pax7P47239 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pax7P47239 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pax7P47239 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Pax7P47239 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Pax7P47239 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pax7P47239 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pax7P47239 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pax7P47239 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pax7P47239 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pax7P47239 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pax7P47239 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pax7P47239 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pax7P47239 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pax7P47239 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms