Protein–RNA interactions for Protein: P46414

Cdkn1b, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn1bP46414 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cdkn1bP46414 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Cdkn1bP46414 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cdkn1bP46414 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Cdkn1bP46414 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cdkn1bP46414 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cdkn1bP46414 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cdkn1bP46414 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Cdkn1bP46414 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cdkn1bP46414 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cdkn1bP46414 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cdkn1bP46414 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cdkn1bP46414 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cdkn1bP46414 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cdkn1bP46414 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cdkn1bP46414 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cdkn1bP46414 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cdkn1bP46414 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cdkn1bP46414 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cdkn1bP46414 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cdkn1bP46414 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cdkn1bP46414 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cdkn1bP46414 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cdkn1bP46414 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cdkn1bP46414 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cdkn1bP46414 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cdkn1bP46414 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdkn1bP46414 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdkn1bP46414 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdkn1bP46414 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdkn1bP46414 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdkn1bP46414 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdkn1bP46414 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdkn1bP46414 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdkn1bP46414 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdkn1bP46414 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdkn1bP46414 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdkn1bP46414 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdkn1bP46414 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdkn1bP46414 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdkn1bP46414 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdkn1bP46414 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdkn1bP46414 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdkn1bP46414 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdkn1bP46414 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdkn1bP46414 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdkn1bP46414 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdkn1bP46414 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdkn1bP46414 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdkn1bP46414 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdkn1bP46414 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdkn1bP46414 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdkn1bP46414 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdkn1bP46414 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdkn1bP46414 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdkn1bP46414 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdkn1bP46414 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdkn1bP46414 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdkn1bP46414 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdkn1bP46414 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdkn1bP46414 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdkn1bP46414 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdkn1bP46414 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdkn1bP46414 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdkn1bP46414 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdkn1bP46414 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdkn1bP46414 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdkn1bP46414 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdkn1bP46414 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdkn1bP46414 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdkn1bP46414 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdkn1bP46414 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdkn1bP46414 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdkn1bP46414 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdkn1bP46414 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdkn1bP46414 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdkn1bP46414 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdkn1bP46414 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdkn1bP46414 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdkn1bP46414 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdkn1bP46414 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdkn1bP46414 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdkn1bP46414 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdkn1bP46414 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdkn1bP46414 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdkn1bP46414 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdkn1bP46414 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdkn1bP46414 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdkn1bP46414 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdkn1bP46414 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdkn1bP46414 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdkn1bP46414 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdkn1bP46414 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdkn1bP46414 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdkn1bP46414 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdkn1bP46414 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdkn1bP46414 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdkn1bP46414 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdkn1bP46414 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdkn1bP46414 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms