Protein–RNA interactions for Protein: P46096

Syt1, Synaptotagmin-1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syt1P46096 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Syt1P46096 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Syt1P46096 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Syt1P46096 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Syt1P46096 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Syt1P46096 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Syt1P46096 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Syt1P46096 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Syt1P46096 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Syt1P46096 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Syt1P46096 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Syt1P46096 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Syt1P46096 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Syt1P46096 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Syt1P46096 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Syt1P46096 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Syt1P46096 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Syt1P46096 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Syt1P46096 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Syt1P46096 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Syt1P46096 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Syt1P46096 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Syt1P46096 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Syt1P46096 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Syt1P46096 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Syt1P46096 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Syt1P46096 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Syt1P46096 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Syt1P46096 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Syt1P46096 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Syt1P46096 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Syt1P46096 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Syt1P46096 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Syt1P46096 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Syt1P46096 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Syt1P46096 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Syt1P46096 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Syt1P46096 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Syt1P46096 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Syt1P46096 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Syt1P46096 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Syt1P46096 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Syt1P46096 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Syt1P46096 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Syt1P46096 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Syt1P46096 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Syt1P46096 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Syt1P46096 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Syt1P46096 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Syt1P46096 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Syt1P46096 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Syt1P46096 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Syt1P46096 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Syt1P46096 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Syt1P46096 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Syt1P46096 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Syt1P46096 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Syt1P46096 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Syt1P46096 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Syt1P46096 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Syt1P46096 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Syt1P46096 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Syt1P46096 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Syt1P46096 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Syt1P46096 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Syt1P46096 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Syt1P46096 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Syt1P46096 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Syt1P46096 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Syt1P46096 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Syt1P46096 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Syt1P46096 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Syt1P46096 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Syt1P46096 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Syt1P46096 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Syt1P46096 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Syt1P46096 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Syt1P46096 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Syt1P46096 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Syt1P46096 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Syt1P46096 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Syt1P46096 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Syt1P46096 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Syt1P46096 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Syt1P46096 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Syt1P46096 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Syt1P46096 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Syt1P46096 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Syt1P46096 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Syt1P46096 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Syt1P46096 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Syt1P46096 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Syt1P46096 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Syt1P46096 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Syt1P46096 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Syt1P46096 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Syt1P46096 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Syt1P46096 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Syt1P46096 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Syt1P46096 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms