Protein–RNA interactions for Protein: P43488

Tnfsf4, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 4, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf4P43488 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnfsf4P43488 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnfsf4P43488 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnfsf4P43488 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnfsf4P43488 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnfsf4P43488 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnfsf4P43488 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnfsf4P43488 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnfsf4P43488 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnfsf4P43488 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnfsf4P43488 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnfsf4P43488 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnfsf4P43488 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnfsf4P43488 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnfsf4P43488 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnfsf4P43488 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnfsf4P43488 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnfsf4P43488 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tnfsf4P43488 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnfsf4P43488 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnfsf4P43488 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnfsf4P43488 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnfsf4P43488 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnfsf4P43488 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnfsf4P43488 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnfsf4P43488 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnfsf4P43488 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnfsf4P43488 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnfsf4P43488 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnfsf4P43488 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnfsf4P43488 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnfsf4P43488 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnfsf4P43488 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnfsf4P43488 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnfsf4P43488 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tnfsf4P43488 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnfsf4P43488 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnfsf4P43488 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnfsf4P43488 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnfsf4P43488 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnfsf4P43488 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnfsf4P43488 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnfsf4P43488 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnfsf4P43488 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnfsf4P43488 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnfsf4P43488 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnfsf4P43488 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnfsf4P43488 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnfsf4P43488 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnfsf4P43488 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnfsf4P43488 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnfsf4P43488 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnfsf4P43488 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tnfsf4P43488 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnfsf4P43488 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnfsf4P43488 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnfsf4P43488 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnfsf4P43488 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnfsf4P43488 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnfsf4P43488 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnfsf4P43488 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnfsf4P43488 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnfsf4P43488 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnfsf4P43488 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnfsf4P43488 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tnfsf4P43488 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnfsf4P43488 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnfsf4P43488 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnfsf4P43488 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnfsf4P43488 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnfsf4P43488 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnfsf4P43488 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnfsf4P43488 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnfsf4P43488 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnfsf4P43488 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnfsf4P43488 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnfsf4P43488 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnfsf4P43488 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnfsf4P43488 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnfsf4P43488 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnfsf4P43488 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnfsf4P43488 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnfsf4P43488 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tnfsf4P43488 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tnfsf4P43488 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tnfsf4P43488 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tnfsf4P43488 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tnfsf4P43488 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tnfsf4P43488 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tnfsf4P43488 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnfsf4P43488 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnfsf4P43488 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnfsf4P43488 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnfsf4P43488 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnfsf4P43488 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnfsf4P43488 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnfsf4P43488 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnfsf4P43488 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnfsf4P43488 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnfsf4P43488 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms