Protein–RNA interactions for Protein: P43300

Egr3, Early growth response protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Egr3P43300 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Egr3P43300 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Egr3P43300 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Egr3P43300 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Egr3P43300 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Egr3P43300 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Egr3P43300 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Egr3P43300 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Egr3P43300 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Egr3P43300 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Egr3P43300 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Egr3P43300 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Egr3P43300 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Egr3P43300 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Egr3P43300 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Egr3P43300 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Egr3P43300 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Egr3P43300 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Egr3P43300 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Egr3P43300 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Egr3P43300 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Egr3P43300 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Egr3P43300 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Egr3P43300 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Egr3P43300 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Egr3P43300 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Egr3P43300 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Egr3P43300 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Egr3P43300 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Egr3P43300 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Egr3P43300 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Egr3P43300 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Egr3P43300 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Egr3P43300 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Egr3P43300 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Egr3P43300 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Egr3P43300 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Egr3P43300 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Egr3P43300 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Egr3P43300 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Egr3P43300 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Egr3P43300 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Egr3P43300 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Egr3P43300 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Egr3P43300 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Egr3P43300 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Egr3P43300 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Egr3P43300 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Egr3P43300 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Egr3P43300 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Egr3P43300 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Egr3P43300 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Egr3P43300 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Egr3P43300 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Egr3P43300 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Egr3P43300 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Egr3P43300 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Egr3P43300 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Egr3P43300 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Egr3P43300 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Egr3P43300 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Egr3P43300 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Egr3P43300 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Egr3P43300 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Egr3P43300 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Egr3P43300 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Egr3P43300 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Egr3P43300 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Egr3P43300 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Egr3P43300 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Egr3P43300 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Egr3P43300 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Egr3P43300 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Egr3P43300 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Egr3P43300 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Egr3P43300 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Egr3P43300 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Egr3P43300 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Egr3P43300 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Egr3P43300 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Egr3P43300 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Egr3P43300 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Egr3P43300 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Egr3P43300 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Egr3P43300 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Egr3P43300 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Egr3P43300 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Egr3P43300 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Egr3P43300 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Egr3P43300 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Egr3P43300 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Egr3P43300 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Egr3P43300 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Egr3P43300 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Egr3P43300 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Egr3P43300 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Egr3P43300 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Egr3P43300 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Egr3P43300 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Egr3P43300 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms