Protein–RNA interactions for Protein: P43117

Ptgfr, Prostaglandin F2-alpha receptor, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgfrP43117 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PtgfrP43117 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PtgfrP43117 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PtgfrP43117 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PtgfrP43117 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PtgfrP43117 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PtgfrP43117 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PtgfrP43117 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PtgfrP43117 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PtgfrP43117 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PtgfrP43117 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PtgfrP43117 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PtgfrP43117 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PtgfrP43117 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PtgfrP43117 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PtgfrP43117 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PtgfrP43117 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PtgfrP43117 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PtgfrP43117 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PtgfrP43117 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PtgfrP43117 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PtgfrP43117 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PtgfrP43117 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PtgfrP43117 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PtgfrP43117 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PtgfrP43117 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PtgfrP43117 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PtgfrP43117 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PtgfrP43117 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PtgfrP43117 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PtgfrP43117 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PtgfrP43117 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PtgfrP43117 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PtgfrP43117 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PtgfrP43117 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PtgfrP43117 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PtgfrP43117 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PtgfrP43117 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PtgfrP43117 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PtgfrP43117 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PtgfrP43117 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PtgfrP43117 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PtgfrP43117 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PtgfrP43117 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PtgfrP43117 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PtgfrP43117 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PtgfrP43117 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PtgfrP43117 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PtgfrP43117 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PtgfrP43117 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PtgfrP43117 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PtgfrP43117 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PtgfrP43117 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PtgfrP43117 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PtgfrP43117 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PtgfrP43117 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PtgfrP43117 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PtgfrP43117 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PtgfrP43117 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PtgfrP43117 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PtgfrP43117 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PtgfrP43117 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PtgfrP43117 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PtgfrP43117 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PtgfrP43117 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PtgfrP43117 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PtgfrP43117 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PtgfrP43117 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PtgfrP43117 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PtgfrP43117 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PtgfrP43117 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PtgfrP43117 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PtgfrP43117 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PtgfrP43117 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PtgfrP43117 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PtgfrP43117 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PtgfrP43117 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PtgfrP43117 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PtgfrP43117 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PtgfrP43117 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PtgfrP43117 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PtgfrP43117 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PtgfrP43117 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PtgfrP43117 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PtgfrP43117 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PtgfrP43117 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PtgfrP43117 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PtgfrP43117 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PtgfrP43117 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PtgfrP43117 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PtgfrP43117 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PtgfrP43117 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PtgfrP43117 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PtgfrP43117 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PtgfrP43117 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PtgfrP43117 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PtgfrP43117 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PtgfrP43117 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PtgfrP43117 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PtgfrP43117 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms