Protein–RNA interactions for Protein: P43027

Gdf5, Growth/differentiation factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf5P43027 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gdf5P43027 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Gdf5P43027 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gdf5P43027 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gdf5P43027 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gdf5P43027 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gdf5P43027 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gdf5P43027 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gdf5P43027 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gdf5P43027 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gdf5P43027 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gdf5P43027 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gdf5P43027 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gdf5P43027 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gdf5P43027 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gdf5P43027 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gdf5P43027 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gdf5P43027 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gdf5P43027 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gdf5P43027 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gdf5P43027 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gdf5P43027 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gdf5P43027 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gdf5P43027 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gdf5P43027 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gdf5P43027 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gdf5P43027 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gdf5P43027 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gdf5P43027 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gdf5P43027 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gdf5P43027 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gdf5P43027 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Gdf5P43027 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gdf5P43027 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gdf5P43027 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gdf5P43027 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gdf5P43027 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gdf5P43027 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gdf5P43027 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gdf5P43027 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gdf5P43027 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gdf5P43027 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gdf5P43027 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gdf5P43027 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gdf5P43027 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gdf5P43027 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gdf5P43027 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gdf5P43027 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gdf5P43027 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gdf5P43027 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gdf5P43027 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Gdf5P43027 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Gdf5P43027 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gdf5P43027 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gdf5P43027 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gdf5P43027 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gdf5P43027 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gdf5P43027 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Gdf5P43027 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gdf5P43027 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gdf5P43027 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gdf5P43027 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gdf5P43027 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gdf5P43027 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gdf5P43027 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gdf5P43027 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gdf5P43027 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gdf5P43027 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gdf5P43027 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Gdf5P43027 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gdf5P43027 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gdf5P43027 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Gdf5P43027 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gdf5P43027 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gdf5P43027 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gdf5P43027 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gdf5P43027 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gdf5P43027 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gdf5P43027 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gdf5P43027 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Gdf5P43027 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gdf5P43027 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gdf5P43027 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gdf5P43027 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gdf5P43027 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gdf5P43027 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gdf5P43027 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Gdf5P43027 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gdf5P43027 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gdf5P43027 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gdf5P43027 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gdf5P43027 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gdf5P43027 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gdf5P43027 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gdf5P43027 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gdf5P43027 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gdf5P43027 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gdf5P43027 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gdf5P43027 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gdf5P43027 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.2 ms