Protein–RNA interactions for Protein: P43025

Clec3b, Tetranectin, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec3bP43025 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clec3bP43025 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clec3bP43025 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clec3bP43025 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Clec3bP43025 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clec3bP43025 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clec3bP43025 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clec3bP43025 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clec3bP43025 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clec3bP43025 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clec3bP43025 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clec3bP43025 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clec3bP43025 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clec3bP43025 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clec3bP43025 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clec3bP43025 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clec3bP43025 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Clec3bP43025 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clec3bP43025 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clec3bP43025 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clec3bP43025 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clec3bP43025 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clec3bP43025 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clec3bP43025 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clec3bP43025 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clec3bP43025 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clec3bP43025 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clec3bP43025 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clec3bP43025 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clec3bP43025 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clec3bP43025 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clec3bP43025 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clec3bP43025 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clec3bP43025 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Clec3bP43025 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clec3bP43025 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clec3bP43025 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clec3bP43025 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clec3bP43025 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clec3bP43025 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clec3bP43025 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clec3bP43025 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clec3bP43025 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clec3bP43025 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clec3bP43025 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clec3bP43025 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clec3bP43025 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clec3bP43025 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Clec3bP43025 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clec3bP43025 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clec3bP43025 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clec3bP43025 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clec3bP43025 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clec3bP43025 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clec3bP43025 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clec3bP43025 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clec3bP43025 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clec3bP43025 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clec3bP43025 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clec3bP43025 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clec3bP43025 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clec3bP43025 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clec3bP43025 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clec3bP43025 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clec3bP43025 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clec3bP43025 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clec3bP43025 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clec3bP43025 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clec3bP43025 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clec3bP43025 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clec3bP43025 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clec3bP43025 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clec3bP43025 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clec3bP43025 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clec3bP43025 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clec3bP43025 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clec3bP43025 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clec3bP43025 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clec3bP43025 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clec3bP43025 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clec3bP43025 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clec3bP43025 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clec3bP43025 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clec3bP43025 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clec3bP43025 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clec3bP43025 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clec3bP43025 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clec3bP43025 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clec3bP43025 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clec3bP43025 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clec3bP43025 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clec3bP43025 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Clec3bP43025 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Clec3bP43025 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Clec3bP43025 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Clec3bP43025 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clec3bP43025 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clec3bP43025 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clec3bP43025 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clec3bP43025 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms