Protein–RNA interactions for Protein: P42580

Nkx1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx1-2P42580 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nkx1-2P42580 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nkx1-2P42580 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nkx1-2P42580 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nkx1-2P42580 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nkx1-2P42580 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nkx1-2P42580 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Nkx1-2P42580 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nkx1-2P42580 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nkx1-2P42580 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nkx1-2P42580 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nkx1-2P42580 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nkx1-2P42580 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nkx1-2P42580 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nkx1-2P42580 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nkx1-2P42580 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nkx1-2P42580 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Nkx1-2P42580 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nkx1-2P42580 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nkx1-2P42580 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nkx1-2P42580 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Nkx1-2P42580 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nkx1-2P42580 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nkx1-2P42580 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nkx1-2P42580 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nkx1-2P42580 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Nkx1-2P42580 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Nkx1-2P42580 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nkx1-2P42580 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nkx1-2P42580 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nkx1-2P42580 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nkx1-2P42580 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nkx1-2P42580 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nkx1-2P42580 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nkx1-2P42580 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nkx1-2P42580 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nkx1-2P42580 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nkx1-2P42580 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nkx1-2P42580 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nkx1-2P42580 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nkx1-2P42580 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nkx1-2P42580 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nkx1-2P42580 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nkx1-2P42580 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Nkx1-2P42580 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nkx1-2P42580 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nkx1-2P42580 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nkx1-2P42580 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nkx1-2P42580 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nkx1-2P42580 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nkx1-2P42580 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nkx1-2P42580 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nkx1-2P42580 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nkx1-2P42580 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nkx1-2P42580 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nkx1-2P42580 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nkx1-2P42580 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nkx1-2P42580 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nkx1-2P42580 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nkx1-2P42580 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nkx1-2P42580 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nkx1-2P42580 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nkx1-2P42580 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nkx1-2P42580 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nkx1-2P42580 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nkx1-2P42580 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nkx1-2P42580 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nkx1-2P42580 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nkx1-2P42580 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Nkx1-2P42580 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nkx1-2P42580 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nkx1-2P42580 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nkx1-2P42580 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nkx1-2P42580 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nkx1-2P42580 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nkx1-2P42580 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nkx1-2P42580 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nkx1-2P42580 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nkx1-2P42580 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Nkx1-2P42580 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nkx1-2P42580 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nkx1-2P42580 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nkx1-2P42580 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nkx1-2P42580 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nkx1-2P42580 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nkx1-2P42580 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nkx1-2P42580 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nkx1-2P42580 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nkx1-2P42580 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nkx1-2P42580 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Nkx1-2P42580 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nkx1-2P42580 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nkx1-2P42580 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nkx1-2P42580 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nkx1-2P42580 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nkx1-2P42580 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nkx1-2P42580 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nkx1-2P42580 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nkx1-2P42580 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nkx1-2P42580 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms