Protein–RNA interactions for Protein: P41539

Tac1, Protachykinin-1, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tac1P41539 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tac1P41539 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tac1P41539 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tac1P41539 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tac1P41539 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tac1P41539 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tac1P41539 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tac1P41539 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tac1P41539 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tac1P41539 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tac1P41539 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tac1P41539 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tac1P41539 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tac1P41539 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tac1P41539 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tac1P41539 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tac1P41539 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tac1P41539 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tac1P41539 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tac1P41539 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Tac1P41539 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tac1P41539 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tac1P41539 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tac1P41539 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tac1P41539 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Tac1P41539 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tac1P41539 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tac1P41539 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tac1P41539 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tac1P41539 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tac1P41539 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tac1P41539 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tac1P41539 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tac1P41539 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Tac1P41539 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tac1P41539 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tac1P41539 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tac1P41539 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tac1P41539 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tac1P41539 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tac1P41539 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tac1P41539 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tac1P41539 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tac1P41539 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tac1P41539 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tac1P41539 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tac1P41539 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tac1P41539 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tac1P41539 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tac1P41539 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tac1P41539 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tac1P41539 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tac1P41539 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tac1P41539 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tac1P41539 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Tac1P41539 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tac1P41539 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tac1P41539 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tac1P41539 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tac1P41539 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tac1P41539 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tac1P41539 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tac1P41539 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tac1P41539 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tac1P41539 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tac1P41539 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tac1P41539 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tac1P41539 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tac1P41539 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tac1P41539 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tac1P41539 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tac1P41539 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Tac1P41539 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tac1P41539 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tac1P41539 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tac1P41539 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tac1P41539 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tac1P41539 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tac1P41539 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tac1P41539 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tac1P41539 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tac1P41539 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Tac1P41539 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tac1P41539 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tac1P41539 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tac1P41539 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tac1P41539 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tac1P41539 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tac1P41539 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tac1P41539 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tac1P41539 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tac1P41539 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tac1P41539 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tac1P41539 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tac1P41539 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tac1P41539 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tac1P41539 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tac1P41539 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tac1P41539 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Tac1P41539 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms