Protein–RNA interactions for Protein: P40201

Chd1, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd1P40201 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Chd1P40201 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Chd1P40201 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Chd1P40201 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Chd1P40201 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Chd1P40201 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Chd1P40201 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Chd1P40201 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Chd1P40201 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Chd1P40201 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Chd1P40201 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Chd1P40201 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Chd1P40201 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Chd1P40201 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Chd1P40201 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Chd1P40201 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Chd1P40201 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Chd1P40201 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Chd1P40201 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Chd1P40201 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Chd1P40201 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Chd1P40201 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Chd1P40201 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Chd1P40201 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Chd1P40201 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Chd1P40201 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Chd1P40201 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Chd1P40201 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Chd1P40201 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Chd1P40201 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Chd1P40201 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Chd1P40201 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Chd1P40201 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Chd1P40201 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Chd1P40201 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Chd1P40201 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Chd1P40201 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Chd1P40201 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Chd1P40201 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Chd1P40201 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Chd1P40201 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Chd1P40201 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Chd1P40201 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Chd1P40201 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Chd1P40201 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Chd1P40201 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Chd1P40201 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Chd1P40201 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Chd1P40201 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Chd1P40201 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Chd1P40201 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Chd1P40201 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Chd1P40201 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Chd1P40201 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Chd1P40201 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Chd1P40201 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Chd1P40201 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Chd1P40201 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Chd1P40201 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Chd1P40201 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Chd1P40201 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Chd1P40201 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Chd1P40201 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Chd1P40201 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Chd1P40201 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Chd1P40201 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Chd1P40201 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Chd1P40201 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Chd1P40201 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Chd1P40201 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Chd1P40201 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Chd1P40201 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Chd1P40201 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Chd1P40201 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Chd1P40201 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Chd1P40201 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Chd1P40201 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Chd1P40201 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Chd1P40201 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Chd1P40201 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Chd1P40201 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Chd1P40201 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Chd1P40201 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Chd1P40201 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Chd1P40201 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Chd1P40201 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Chd1P40201 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Chd1P40201 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Chd1P40201 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Chd1P40201 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Chd1P40201 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Chd1P40201 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Chd1P40201 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Chd1P40201 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Chd1P40201 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Chd1P40201 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Chd1P40201 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Chd1P40201 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Chd1P40201 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Chd1P40201 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms