Protein–RNA interactions for Protein: P39087

Grik2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik2P39087 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Grik2P39087 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Grik2P39087 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Grik2P39087 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Grik2P39087 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Grik2P39087 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Grik2P39087 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Grik2P39087 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Grik2P39087 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Grik2P39087 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Grik2P39087 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Grik2P39087 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Grik2P39087 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Grik2P39087 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Grik2P39087 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Grik2P39087 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Grik2P39087 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Grik2P39087 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Grik2P39087 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Grik2P39087 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Grik2P39087 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Grik2P39087 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Grik2P39087 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Grik2P39087 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Grik2P39087 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Grik2P39087 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Grik2P39087 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Grik2P39087 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Grik2P39087 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Grik2P39087 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Grik2P39087 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Grik2P39087 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Grik2P39087 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Grik2P39087 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Grik2P39087 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Grik2P39087 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Grik2P39087 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Grik2P39087 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Grik2P39087 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Grik2P39087 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Grik2P39087 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Grik2P39087 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Grik2P39087 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Grik2P39087 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Grik2P39087 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Grik2P39087 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Grik2P39087 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Grik2P39087 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Grik2P39087 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Grik2P39087 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Grik2P39087 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Grik2P39087 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Grik2P39087 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Grik2P39087 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Grik2P39087 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Grik2P39087 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Grik2P39087 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Grik2P39087 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Grik2P39087 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Grik2P39087 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Grik2P39087 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Grik2P39087 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Grik2P39087 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Grik2P39087 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Grik2P39087 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Grik2P39087 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Grik2P39087 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Grik2P39087 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Grik2P39087 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Grik2P39087 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Grik2P39087 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Grik2P39087 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Grik2P39087 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Grik2P39087 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Grik2P39087 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Grik2P39087 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Grik2P39087 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Grik2P39087 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Grik2P39087 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Grik2P39087 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Grik2P39087 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Grik2P39087 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Grik2P39087 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Grik2P39087 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Grik2P39087 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Grik2P39087 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Grik2P39087 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Grik2P39087 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Grik2P39087 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Grik2P39087 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Grik2P39087 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Grik2P39087 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Grik2P39087 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Grik2P39087 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Grik2P39087 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Grik2P39087 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Grik2P39087 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Grik2P39087 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Grik2P39087 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Grik2P39087 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms