Protein–RNA interactions for Protein: P37913

Lig1, DNA ligase 1, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig1P37913 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Lig1P37913 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lig1P37913 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lig1P37913 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lig1P37913 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lig1P37913 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lig1P37913 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lig1P37913 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lig1P37913 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lig1P37913 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lig1P37913 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lig1P37913 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lig1P37913 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lig1P37913 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lig1P37913 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lig1P37913 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Lig1P37913 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lig1P37913 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lig1P37913 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lig1P37913 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lig1P37913 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Lig1P37913 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lig1P37913 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lig1P37913 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lig1P37913 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lig1P37913 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lig1P37913 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lig1P37913 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lig1P37913 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lig1P37913 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lig1P37913 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lig1P37913 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lig1P37913 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lig1P37913 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lig1P37913 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lig1P37913 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lig1P37913 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lig1P37913 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lig1P37913 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lig1P37913 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lig1P37913 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Lig1P37913 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lig1P37913 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Lig1P37913 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lig1P37913 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lig1P37913 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lig1P37913 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Lig1P37913 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Lig1P37913 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Lig1P37913 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Lig1P37913 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Lig1P37913 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lig1P37913 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lig1P37913 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lig1P37913 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lig1P37913 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lig1P37913 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lig1P37913 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lig1P37913 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lig1P37913 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lig1P37913 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lig1P37913 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lig1P37913 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lig1P37913 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Lig1P37913 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lig1P37913 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Lig1P37913 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lig1P37913 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lig1P37913 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lig1P37913 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lig1P37913 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lig1P37913 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lig1P37913 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Lig1P37913 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lig1P37913 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lig1P37913 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lig1P37913 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lig1P37913 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lig1P37913 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lig1P37913 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lig1P37913 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lig1P37913 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lig1P37913 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lig1P37913 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lig1P37913 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lig1P37913 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lig1P37913 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Lig1P37913 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lig1P37913 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lig1P37913 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lig1P37913 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lig1P37913 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lig1P37913 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lig1P37913 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lig1P37913 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lig1P37913 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lig1P37913 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lig1P37913 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lig1P37913 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lig1P37913 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms