Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
PtprkP35822 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PtprkP35822 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PtprkP35822 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PtprkP35822 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
PtprkP35822 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
PtprkP35822 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PtprkP35822 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PtprkP35822 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PtprkP35822 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PtprkP35822 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PtprkP35822 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
PtprkP35822 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PtprkP35822 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
PtprkP35822 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PtprkP35822 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PtprkP35822 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
PtprkP35822 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PtprkP35822 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PtprkP35822 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PtprkP35822 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
PtprkP35822 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PtprkP35822 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PtprkP35822 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
PtprkP35822 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
PtprkP35822 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PtprkP35822 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PtprkP35822 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PtprkP35822 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PtprkP35822 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
PtprkP35822 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
PtprkP35822 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PtprkP35822 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PtprkP35822 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
PtprkP35822 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PtprkP35822 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PtprkP35822 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PtprkP35822 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
PtprkP35822 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PtprkP35822 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PtprkP35822 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PtprkP35822 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PtprkP35822 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PtprkP35822 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PtprkP35822 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
PtprkP35822 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PtprkP35822 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PtprkP35822 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PtprkP35822 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PtprkP35822 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PtprkP35822 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PtprkP35822 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PtprkP35822 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PtprkP35822 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PtprkP35822 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PtprkP35822 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PtprkP35822 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PtprkP35822 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PtprkP35822 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PtprkP35822 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PtprkP35822 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PtprkP35822 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
PtprkP35822 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PtprkP35822 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PtprkP35822 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PtprkP35822 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PtprkP35822 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PtprkP35822 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
PtprkP35822 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
PtprkP35822 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
PtprkP35822 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
PtprkP35822 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
PtprkP35822 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PtprkP35822 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PtprkP35822 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PtprkP35822 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PtprkP35822 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PtprkP35822 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
PtprkP35822 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
PtprkP35822 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
PtprkP35822 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
PtprkP35822 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
PtprkP35822 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PtprkP35822 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
PtprkP35822 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
PtprkP35822 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
PtprkP35822 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
PtprkP35822 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PtprkP35822 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PtprkP35822 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PtprkP35822 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
PtprkP35822 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
PtprkP35822 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
PtprkP35822 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PtprkP35822 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PtprkP35822 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
PtprkP35822 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PtprkP35822 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PtprkP35822 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PtprkP35822 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms