Protein–RNA interactions for Protein: P35419

Tpo, Thyroid peroxidase, mousemouse

Predictions only

Length 914 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TpoP35419 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TpoP35419 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TpoP35419 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
TpoP35419 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TpoP35419 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TpoP35419 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TpoP35419 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TpoP35419 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TpoP35419 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TpoP35419 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TpoP35419 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TpoP35419 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TpoP35419 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TpoP35419 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TpoP35419 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TpoP35419 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TpoP35419 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TpoP35419 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TpoP35419 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TpoP35419 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TpoP35419 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TpoP35419 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TpoP35419 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TpoP35419 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TpoP35419 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TpoP35419 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TpoP35419 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TpoP35419 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TpoP35419 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TpoP35419 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TpoP35419 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TpoP35419 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TpoP35419 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TpoP35419 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TpoP35419 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TpoP35419 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TpoP35419 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TpoP35419 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TpoP35419 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TpoP35419 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TpoP35419 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TpoP35419 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TpoP35419 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TpoP35419 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TpoP35419 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TpoP35419 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TpoP35419 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TpoP35419 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TpoP35419 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TpoP35419 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TpoP35419 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TpoP35419 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TpoP35419 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TpoP35419 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TpoP35419 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TpoP35419 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TpoP35419 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TpoP35419 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TpoP35419 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TpoP35419 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TpoP35419 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TpoP35419 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TpoP35419 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TpoP35419 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TpoP35419 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TpoP35419 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TpoP35419 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TpoP35419 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TpoP35419 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TpoP35419 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TpoP35419 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TpoP35419 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TpoP35419 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TpoP35419 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TpoP35419 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TpoP35419 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TpoP35419 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TpoP35419 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TpoP35419 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TpoP35419 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TpoP35419 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TpoP35419 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TpoP35419 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TpoP35419 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TpoP35419 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TpoP35419 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TpoP35419 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TpoP35419 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
TpoP35419 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TpoP35419 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TpoP35419 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
TpoP35419 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TpoP35419 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TpoP35419 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
TpoP35419 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TpoP35419 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TpoP35419 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TpoP35419 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TpoP35419 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TpoP35419 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms