Protein–RNA interactions for Protein: P35396

Ppard, Peroxisome proliferator-activated receptor delta, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpardP35396 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PpardP35396 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PpardP35396 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PpardP35396 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PpardP35396 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PpardP35396 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PpardP35396 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PpardP35396 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PpardP35396 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PpardP35396 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PpardP35396 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PpardP35396 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PpardP35396 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PpardP35396 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
PpardP35396 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PpardP35396 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PpardP35396 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PpardP35396 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PpardP35396 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PpardP35396 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PpardP35396 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PpardP35396 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PpardP35396 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PpardP35396 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PpardP35396 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PpardP35396 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PpardP35396 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PpardP35396 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PpardP35396 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PpardP35396 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PpardP35396 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PpardP35396 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PpardP35396 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
PpardP35396 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PpardP35396 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PpardP35396 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
PpardP35396 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PpardP35396 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PpardP35396 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PpardP35396 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PpardP35396 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PpardP35396 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PpardP35396 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PpardP35396 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PpardP35396 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PpardP35396 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PpardP35396 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PpardP35396 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PpardP35396 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PpardP35396 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PpardP35396 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PpardP35396 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PpardP35396 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PpardP35396 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PpardP35396 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PpardP35396 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PpardP35396 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
PpardP35396 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PpardP35396 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PpardP35396 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PpardP35396 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PpardP35396 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PpardP35396 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
PpardP35396 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
PpardP35396 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
PpardP35396 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
PpardP35396 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PpardP35396 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PpardP35396 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PpardP35396 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PpardP35396 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PpardP35396 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PpardP35396 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PpardP35396 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PpardP35396 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PpardP35396 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PpardP35396 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PpardP35396 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PpardP35396 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PpardP35396 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PpardP35396 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PpardP35396 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PpardP35396 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PpardP35396 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PpardP35396 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PpardP35396 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PpardP35396 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PpardP35396 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PpardP35396 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PpardP35396 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PpardP35396 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PpardP35396 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PpardP35396 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PpardP35396 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PpardP35396 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PpardP35396 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PpardP35396 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PpardP35396 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PpardP35396 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PpardP35396 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms