Protein–RNA interactions for Protein: P35242

Sftpa1, Pulmonary surfactant-associated protein A, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sftpa1P35242 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Sftpa1P35242 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sftpa1P35242 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sftpa1P35242 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sftpa1P35242 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sftpa1P35242 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sftpa1P35242 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sftpa1P35242 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sftpa1P35242 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sftpa1P35242 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sftpa1P35242 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sftpa1P35242 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sftpa1P35242 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sftpa1P35242 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sftpa1P35242 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sftpa1P35242 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sftpa1P35242 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sftpa1P35242 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sftpa1P35242 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sftpa1P35242 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sftpa1P35242 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sftpa1P35242 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sftpa1P35242 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sftpa1P35242 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sftpa1P35242 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Sftpa1P35242 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sftpa1P35242 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sftpa1P35242 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sftpa1P35242 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sftpa1P35242 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sftpa1P35242 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sftpa1P35242 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sftpa1P35242 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Sftpa1P35242 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Sftpa1P35242 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Sftpa1P35242 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sftpa1P35242 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sftpa1P35242 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sftpa1P35242 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sftpa1P35242 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sftpa1P35242 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sftpa1P35242 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Sftpa1P35242 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sftpa1P35242 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Sftpa1P35242 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sftpa1P35242 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sftpa1P35242 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sftpa1P35242 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sftpa1P35242 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sftpa1P35242 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sftpa1P35242 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sftpa1P35242 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sftpa1P35242 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sftpa1P35242 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sftpa1P35242 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sftpa1P35242 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sftpa1P35242 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sftpa1P35242 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sftpa1P35242 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Sftpa1P35242 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sftpa1P35242 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sftpa1P35242 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sftpa1P35242 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sftpa1P35242 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sftpa1P35242 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sftpa1P35242 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sftpa1P35242 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sftpa1P35242 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sftpa1P35242 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sftpa1P35242 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sftpa1P35242 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sftpa1P35242 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Sftpa1P35242 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sftpa1P35242 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sftpa1P35242 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sftpa1P35242 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sftpa1P35242 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sftpa1P35242 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sftpa1P35242 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sftpa1P35242 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sftpa1P35242 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sftpa1P35242 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sftpa1P35242 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sftpa1P35242 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Sftpa1P35242 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Sftpa1P35242 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sftpa1P35242 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sftpa1P35242 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sftpa1P35242 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sftpa1P35242 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sftpa1P35242 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sftpa1P35242 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sftpa1P35242 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sftpa1P35242 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sftpa1P35242 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sftpa1P35242 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sftpa1P35242 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sftpa1P35242 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sftpa1P35242 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sftpa1P35242 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms