Protein–RNA interactions for Protein: P32043

Hoxc5, Homeobox protein Hox-C5, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc5P32043 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxc5P32043 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxc5P32043 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxc5P32043 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxc5P32043 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxc5P32043 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxc5P32043 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxc5P32043 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxc5P32043 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxc5P32043 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxc5P32043 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxc5P32043 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxc5P32043 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxc5P32043 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxc5P32043 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxc5P32043 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxc5P32043 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxc5P32043 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxc5P32043 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxc5P32043 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxc5P32043 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Hoxc5P32043 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxc5P32043 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxc5P32043 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxc5P32043 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxc5P32043 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxc5P32043 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxc5P32043 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxc5P32043 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxc5P32043 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxc5P32043 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxc5P32043 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxc5P32043 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxc5P32043 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxc5P32043 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxc5P32043 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxc5P32043 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxc5P32043 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxc5P32043 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxc5P32043 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxc5P32043 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxc5P32043 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxc5P32043 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxc5P32043 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxc5P32043 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxc5P32043 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxc5P32043 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxc5P32043 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxc5P32043 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxc5P32043 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxc5P32043 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxc5P32043 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxc5P32043 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxc5P32043 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxc5P32043 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxc5P32043 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxc5P32043 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxc5P32043 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxc5P32043 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxc5P32043 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxc5P32043 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxc5P32043 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxc5P32043 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxc5P32043 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxc5P32043 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxc5P32043 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxc5P32043 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxc5P32043 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxc5P32043 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxc5P32043 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxc5P32043 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxc5P32043 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxc5P32043 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxc5P32043 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxc5P32043 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxc5P32043 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxc5P32043 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxc5P32043 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxc5P32043 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxc5P32043 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxc5P32043 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxc5P32043 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxc5P32043 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxc5P32043 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxc5P32043 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxc5P32043 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxc5P32043 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxc5P32043 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxc5P32043 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxc5P32043 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxc5P32043 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxc5P32043 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxc5P32043 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxc5P32043 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxc5P32043 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxc5P32043 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxc5P32043 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxc5P32043 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxc5P32043 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxc5P32043 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms