Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxc11P31313 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxc11P31313 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxc11P31313 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxc11P31313 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxc11P31313 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxc11P31313 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxc11P31313 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxc11P31313 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxc11P31313 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxc11P31313 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxc11P31313 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxc11P31313 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxc11P31313 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxc11P31313 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxc11P31313 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxc11P31313 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxc11P31313 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxc11P31313 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxc11P31313 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxc11P31313 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxc11P31313 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxc11P31313 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxc11P31313 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxc11P31313 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxc11P31313 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxc11P31313 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxc11P31313 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxc11P31313 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxc11P31313 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxc11P31313 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Hoxc11P31313 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Hoxc11P31313 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Hoxc11P31313 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxc11P31313 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxc11P31313 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxc11P31313 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxc11P31313 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxc11P31313 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxc11P31313 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxc11P31313 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxc11P31313 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxc11P31313 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxc11P31313 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxc11P31313 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxc11P31313 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxc11P31313 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxc11P31313 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxc11P31313 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxc11P31313 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxc11P31313 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxc11P31313 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxc11P31313 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxc11P31313 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxc11P31313 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxc11P31313 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxc11P31313 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxc11P31313 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxc11P31313 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxc11P31313 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxc11P31313 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxc11P31313 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxc11P31313 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxc11P31313 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxc11P31313 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxc11P31313 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxc11P31313 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxc11P31313 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxc11P31313 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxc11P31313 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxc11P31313 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxc11P31313 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxc11P31313 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxc11P31313 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxc11P31313 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxc11P31313 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxc11P31313 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxc11P31313 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxc11P31313 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxc11P31313 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxc11P31313 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxc11P31313 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxc11P31313 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxc11P31313 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxc11P31313 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxc11P31313 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxc11P31313 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxc11P31313 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxc11P31313 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hoxc11P31313 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxc11P31313 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxc11P31313 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxc11P31313 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxc11P31313 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hoxc11P31313 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxc11P31313 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxc11P31313 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxc11P31313 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxc11P31313 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxc11P31313 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms