Protein–RNA interactions for Protein: P30548

Tacr1, Substance-P receptor, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tacr1P30548 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tacr1P30548 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tacr1P30548 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tacr1P30548 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tacr1P30548 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tacr1P30548 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tacr1P30548 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tacr1P30548 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tacr1P30548 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tacr1P30548 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tacr1P30548 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Tacr1P30548 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tacr1P30548 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Tacr1P30548 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tacr1P30548 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tacr1P30548 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tacr1P30548 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tacr1P30548 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tacr1P30548 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tacr1P30548 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tacr1P30548 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tacr1P30548 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tacr1P30548 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tacr1P30548 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tacr1P30548 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tacr1P30548 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tacr1P30548 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tacr1P30548 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Tacr1P30548 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tacr1P30548 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tacr1P30548 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tacr1P30548 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tacr1P30548 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tacr1P30548 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tacr1P30548 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tacr1P30548 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tacr1P30548 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Tacr1P30548 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tacr1P30548 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tacr1P30548 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tacr1P30548 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tacr1P30548 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tacr1P30548 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tacr1P30548 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tacr1P30548 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Tacr1P30548 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Tacr1P30548 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tacr1P30548 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tacr1P30548 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tacr1P30548 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tacr1P30548 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tacr1P30548 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tacr1P30548 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Tacr1P30548 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tacr1P30548 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tacr1P30548 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tacr1P30548 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tacr1P30548 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tacr1P30548 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Tacr1P30548 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tacr1P30548 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tacr1P30548 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tacr1P30548 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tacr1P30548 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Tacr1P30548 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tacr1P30548 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tacr1P30548 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tacr1P30548 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tacr1P30548 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tacr1P30548 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tacr1P30548 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tacr1P30548 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tacr1P30548 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tacr1P30548 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Tacr1P30548 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tacr1P30548 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tacr1P30548 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tacr1P30548 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tacr1P30548 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tacr1P30548 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Tacr1P30548 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tacr1P30548 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tacr1P30548 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tacr1P30548 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tacr1P30548 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tacr1P30548 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Tacr1P30548 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tacr1P30548 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tacr1P30548 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tacr1P30548 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tacr1P30548 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tacr1P30548 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tacr1P30548 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tacr1P30548 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tacr1P30548 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tacr1P30548 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tacr1P30548 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tacr1P30548 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tacr1P30548 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tacr1P30548 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms