Protein–RNA interactions for Protein: P28352

Apex1, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apex1P28352 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Apex1P28352 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Apex1P28352 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Apex1P28352 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Apex1P28352 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Apex1P28352 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Apex1P28352 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Apex1P28352 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Apex1P28352 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Apex1P28352 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Apex1P28352 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Apex1P28352 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Apex1P28352 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Apex1P28352 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Apex1P28352 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Apex1P28352 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Apex1P28352 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Apex1P28352 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Apex1P28352 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Apex1P28352 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Apex1P28352 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Apex1P28352 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Apex1P28352 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Apex1P28352 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Apex1P28352 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Apex1P28352 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Apex1P28352 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Apex1P28352 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Apex1P28352 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Apex1P28352 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Apex1P28352 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Apex1P28352 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Apex1P28352 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Apex1P28352 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Apex1P28352 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Apex1P28352 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Apex1P28352 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Apex1P28352 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Apex1P28352 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Apex1P28352 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Apex1P28352 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Apex1P28352 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Apex1P28352 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Apex1P28352 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Apex1P28352 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Apex1P28352 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Apex1P28352 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Apex1P28352 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Apex1P28352 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Apex1P28352 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Apex1P28352 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Apex1P28352 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Apex1P28352 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Apex1P28352 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Apex1P28352 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Apex1P28352 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Apex1P28352 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Apex1P28352 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Apex1P28352 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Apex1P28352 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Apex1P28352 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Apex1P28352 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Apex1P28352 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Apex1P28352 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Apex1P28352 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Apex1P28352 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Apex1P28352 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Apex1P28352 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Apex1P28352 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Apex1P28352 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Apex1P28352 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Apex1P28352 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Apex1P28352 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Apex1P28352 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Apex1P28352 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Apex1P28352 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Apex1P28352 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Apex1P28352 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Apex1P28352 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Apex1P28352 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Apex1P28352 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Apex1P28352 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Apex1P28352 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Apex1P28352 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Apex1P28352 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Apex1P28352 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Apex1P28352 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Apex1P28352 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Apex1P28352 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Apex1P28352 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Apex1P28352 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Apex1P28352 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Apex1P28352 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Apex1P28352 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Apex1P28352 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Apex1P28352 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Apex1P28352 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Apex1P28352 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Apex1P28352 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Apex1P28352 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms