Protein–RNA interactions for Protein: P27664

Pde6a, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6aP27664 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Pde6aP27664 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Pde6aP27664 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pde6aP27664 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pde6aP27664 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pde6aP27664 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pde6aP27664 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pde6aP27664 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pde6aP27664 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pde6aP27664 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pde6aP27664 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pde6aP27664 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pde6aP27664 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Pde6aP27664 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pde6aP27664 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pde6aP27664 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pde6aP27664 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Pde6aP27664 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pde6aP27664 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pde6aP27664 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Pde6aP27664 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pde6aP27664 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pde6aP27664 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pde6aP27664 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pde6aP27664 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pde6aP27664 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pde6aP27664 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pde6aP27664 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pde6aP27664 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pde6aP27664 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Pde6aP27664 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pde6aP27664 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pde6aP27664 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pde6aP27664 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pde6aP27664 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pde6aP27664 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pde6aP27664 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pde6aP27664 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Pde6aP27664 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pde6aP27664 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pde6aP27664 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pde6aP27664 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pde6aP27664 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pde6aP27664 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pde6aP27664 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pde6aP27664 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pde6aP27664 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pde6aP27664 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pde6aP27664 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pde6aP27664 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pde6aP27664 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pde6aP27664 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pde6aP27664 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pde6aP27664 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pde6aP27664 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pde6aP27664 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pde6aP27664 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pde6aP27664 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pde6aP27664 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pde6aP27664 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pde6aP27664 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pde6aP27664 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pde6aP27664 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pde6aP27664 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pde6aP27664 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pde6aP27664 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pde6aP27664 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Pde6aP27664 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pde6aP27664 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pde6aP27664 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pde6aP27664 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pde6aP27664 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pde6aP27664 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pde6aP27664 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pde6aP27664 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pde6aP27664 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pde6aP27664 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pde6aP27664 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pde6aP27664 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Pde6aP27664 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pde6aP27664 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pde6aP27664 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pde6aP27664 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pde6aP27664 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pde6aP27664 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pde6aP27664 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pde6aP27664 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pde6aP27664 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pde6aP27664 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Pde6aP27664 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Pde6aP27664 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pde6aP27664 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pde6aP27664 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pde6aP27664 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pde6aP27664 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pde6aP27664 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pde6aP27664 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pde6aP27664 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pde6aP27664 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pde6aP27664 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
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