Protein–RNA interactions for Protein: P27090

Tgfb2, Transforming growth factor beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb2P27090 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tgfb2P27090 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tgfb2P27090 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tgfb2P27090 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tgfb2P27090 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tgfb2P27090 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tgfb2P27090 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Tgfb2P27090 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tgfb2P27090 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tgfb2P27090 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tgfb2P27090 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tgfb2P27090 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Tgfb2P27090 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tgfb2P27090 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tgfb2P27090 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Tgfb2P27090 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Tgfb2P27090 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tgfb2P27090 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tgfb2P27090 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tgfb2P27090 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tgfb2P27090 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tgfb2P27090 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tgfb2P27090 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tgfb2P27090 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Tgfb2P27090 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tgfb2P27090 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tgfb2P27090 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Tgfb2P27090 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tgfb2P27090 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tgfb2P27090 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tgfb2P27090 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tgfb2P27090 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Tgfb2P27090 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tgfb2P27090 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tgfb2P27090 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Tgfb2P27090 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tgfb2P27090 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tgfb2P27090 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tgfb2P27090 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tgfb2P27090 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Tgfb2P27090 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Tgfb2P27090 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tgfb2P27090 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tgfb2P27090 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tgfb2P27090 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tgfb2P27090 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tgfb2P27090 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tgfb2P27090 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tgfb2P27090 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tgfb2P27090 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tgfb2P27090 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tgfb2P27090 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tgfb2P27090 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tgfb2P27090 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tgfb2P27090 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tgfb2P27090 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tgfb2P27090 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tgfb2P27090 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tgfb2P27090 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tgfb2P27090 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tgfb2P27090 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tgfb2P27090 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tgfb2P27090 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tgfb2P27090 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Tgfb2P27090 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tgfb2P27090 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tgfb2P27090 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tgfb2P27090 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tgfb2P27090 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tgfb2P27090 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tgfb2P27090 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tgfb2P27090 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Tgfb2P27090 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tgfb2P27090 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tgfb2P27090 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tgfb2P27090 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tgfb2P27090 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tgfb2P27090 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tgfb2P27090 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tgfb2P27090 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tgfb2P27090 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tgfb2P27090 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tgfb2P27090 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tgfb2P27090 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tgfb2P27090 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tgfb2P27090 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tgfb2P27090 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tgfb2P27090 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tgfb2P27090 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tgfb2P27090 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tgfb2P27090 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tgfb2P27090 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tgfb2P27090 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tgfb2P27090 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tgfb2P27090 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tgfb2P27090 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Tgfb2P27090 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tgfb2P27090 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tgfb2P27090 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tgfb2P27090 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms