Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PdgfraP26618 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PdgfraP26618 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PdgfraP26618 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PdgfraP26618 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PdgfraP26618 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PdgfraP26618 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PdgfraP26618 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PdgfraP26618 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PdgfraP26618 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PdgfraP26618 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PdgfraP26618 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PdgfraP26618 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PdgfraP26618 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PdgfraP26618 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PdgfraP26618 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PdgfraP26618 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PdgfraP26618 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PdgfraP26618 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PdgfraP26618 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PdgfraP26618 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PdgfraP26618 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PdgfraP26618 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PdgfraP26618 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PdgfraP26618 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PdgfraP26618 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PdgfraP26618 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PdgfraP26618 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PdgfraP26618 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PdgfraP26618 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PdgfraP26618 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PdgfraP26618 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PdgfraP26618 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PdgfraP26618 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PdgfraP26618 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PdgfraP26618 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PdgfraP26618 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
PdgfraP26618 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PdgfraP26618 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PdgfraP26618 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PdgfraP26618 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PdgfraP26618 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PdgfraP26618 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PdgfraP26618 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
PdgfraP26618 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PdgfraP26618 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
PdgfraP26618 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PdgfraP26618 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PdgfraP26618 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PdgfraP26618 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PdgfraP26618 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PdgfraP26618 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
PdgfraP26618 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PdgfraP26618 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
PdgfraP26618 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PdgfraP26618 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PdgfraP26618 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
PdgfraP26618 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PdgfraP26618 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PdgfraP26618 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PdgfraP26618 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PdgfraP26618 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PdgfraP26618 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PdgfraP26618 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PdgfraP26618 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PdgfraP26618 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PdgfraP26618 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PdgfraP26618 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
PdgfraP26618 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PdgfraP26618 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PdgfraP26618 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PdgfraP26618 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PdgfraP26618 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PdgfraP26618 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PdgfraP26618 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PdgfraP26618 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PdgfraP26618 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PdgfraP26618 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PdgfraP26618 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PdgfraP26618 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PdgfraP26618 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PdgfraP26618 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PdgfraP26618 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PdgfraP26618 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PdgfraP26618 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PdgfraP26618 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PdgfraP26618 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PdgfraP26618 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PdgfraP26618 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PdgfraP26618 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PdgfraP26618 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PdgfraP26618 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PdgfraP26618 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PdgfraP26618 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PdgfraP26618 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PdgfraP26618 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PdgfraP26618 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PdgfraP26618 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PdgfraP26618 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PdgfraP26618 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms