Protein–RNA interactions for Protein: P25976

Ubtf, Nucleolar transcription factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 765 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbtfP25976 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
UbtfP25976 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
UbtfP25976 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
UbtfP25976 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
UbtfP25976 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
UbtfP25976 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
UbtfP25976 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
UbtfP25976 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
UbtfP25976 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
UbtfP25976 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
UbtfP25976 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
UbtfP25976 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
UbtfP25976 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
UbtfP25976 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
UbtfP25976 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
UbtfP25976 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
UbtfP25976 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
UbtfP25976 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
UbtfP25976 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
UbtfP25976 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
UbtfP25976 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
UbtfP25976 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
UbtfP25976 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
UbtfP25976 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
UbtfP25976 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
UbtfP25976 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
UbtfP25976 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
UbtfP25976 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
UbtfP25976 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
UbtfP25976 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
UbtfP25976 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
UbtfP25976 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
UbtfP25976 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
UbtfP25976 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
UbtfP25976 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
UbtfP25976 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
UbtfP25976 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
UbtfP25976 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
UbtfP25976 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
UbtfP25976 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
UbtfP25976 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
UbtfP25976 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
UbtfP25976 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
UbtfP25976 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
UbtfP25976 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
UbtfP25976 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
UbtfP25976 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
UbtfP25976 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
UbtfP25976 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
UbtfP25976 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
UbtfP25976 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
UbtfP25976 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
UbtfP25976 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
UbtfP25976 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
UbtfP25976 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
UbtfP25976 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
UbtfP25976 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
UbtfP25976 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
UbtfP25976 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
UbtfP25976 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
UbtfP25976 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
UbtfP25976 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
UbtfP25976 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
UbtfP25976 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
UbtfP25976 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
UbtfP25976 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
UbtfP25976 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
UbtfP25976 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
UbtfP25976 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
UbtfP25976 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
UbtfP25976 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
UbtfP25976 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
UbtfP25976 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
UbtfP25976 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
UbtfP25976 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
UbtfP25976 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
UbtfP25976 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
UbtfP25976 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
UbtfP25976 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
UbtfP25976 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
UbtfP25976 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
UbtfP25976 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
UbtfP25976 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
UbtfP25976 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
UbtfP25976 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
UbtfP25976 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
UbtfP25976 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
UbtfP25976 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
UbtfP25976 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
UbtfP25976 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
UbtfP25976 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
UbtfP25976 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
UbtfP25976 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
UbtfP25976 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
UbtfP25976 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
UbtfP25976 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
UbtfP25976 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
UbtfP25976 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
UbtfP25976 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
UbtfP25976 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms