Protein–RNA interactions for Protein: P25322

Ccnd1, G1/S-specific cyclin-D1, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnd1P25322 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccnd1P25322 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccnd1P25322 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccnd1P25322 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccnd1P25322 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccnd1P25322 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccnd1P25322 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccnd1P25322 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccnd1P25322 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccnd1P25322 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccnd1P25322 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccnd1P25322 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccnd1P25322 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccnd1P25322 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccnd1P25322 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccnd1P25322 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccnd1P25322 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccnd1P25322 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccnd1P25322 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccnd1P25322 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccnd1P25322 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccnd1P25322 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccnd1P25322 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccnd1P25322 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccnd1P25322 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccnd1P25322 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccnd1P25322 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccnd1P25322 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccnd1P25322 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccnd1P25322 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccnd1P25322 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccnd1P25322 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccnd1P25322 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccnd1P25322 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccnd1P25322 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccnd1P25322 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccnd1P25322 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccnd1P25322 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccnd1P25322 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccnd1P25322 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccnd1P25322 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccnd1P25322 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccnd1P25322 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccnd1P25322 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccnd1P25322 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccnd1P25322 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccnd1P25322 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccnd1P25322 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccnd1P25322 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccnd1P25322 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccnd1P25322 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccnd1P25322 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccnd1P25322 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccnd1P25322 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccnd1P25322 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccnd1P25322 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccnd1P25322 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccnd1P25322 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccnd1P25322 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccnd1P25322 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccnd1P25322 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccnd1P25322 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccnd1P25322 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccnd1P25322 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccnd1P25322 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccnd1P25322 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccnd1P25322 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccnd1P25322 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccnd1P25322 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccnd1P25322 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccnd1P25322 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccnd1P25322 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccnd1P25322 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccnd1P25322 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccnd1P25322 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccnd1P25322 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccnd1P25322 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccnd1P25322 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccnd1P25322 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccnd1P25322 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccnd1P25322 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccnd1P25322 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccnd1P25322 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccnd1P25322 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccnd1P25322 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccnd1P25322 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccnd1P25322 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccnd1P25322 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccnd1P25322 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccnd1P25322 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccnd1P25322 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccnd1P25322 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccnd1P25322 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccnd1P25322 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccnd1P25322 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccnd1P25322 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccnd1P25322 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccnd1P25322 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccnd1P25322 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccnd1P25322 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms