Protein–RNA interactions for Protein: P23298

Prkch, Protein kinase C eta type, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkchP23298 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
PrkchP23298 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PrkchP23298 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PrkchP23298 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PrkchP23298 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PrkchP23298 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PrkchP23298 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PrkchP23298 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PrkchP23298 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PrkchP23298 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PrkchP23298 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PrkchP23298 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PrkchP23298 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PrkchP23298 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PrkchP23298 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PrkchP23298 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PrkchP23298 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PrkchP23298 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PrkchP23298 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PrkchP23298 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PrkchP23298 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PrkchP23298 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PrkchP23298 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PrkchP23298 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PrkchP23298 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PrkchP23298 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PrkchP23298 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PrkchP23298 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PrkchP23298 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PrkchP23298 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PrkchP23298 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PrkchP23298 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
PrkchP23298 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PrkchP23298 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PrkchP23298 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PrkchP23298 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
PrkchP23298 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PrkchP23298 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
PrkchP23298 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PrkchP23298 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PrkchP23298 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PrkchP23298 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PrkchP23298 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PrkchP23298 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PrkchP23298 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PrkchP23298 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PrkchP23298 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PrkchP23298 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PrkchP23298 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PrkchP23298 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PrkchP23298 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PrkchP23298 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PrkchP23298 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PrkchP23298 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PrkchP23298 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PrkchP23298 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PrkchP23298 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
PrkchP23298 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PrkchP23298 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PrkchP23298 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PrkchP23298 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PrkchP23298 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
PrkchP23298 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PrkchP23298 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PrkchP23298 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PrkchP23298 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PrkchP23298 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PrkchP23298 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PrkchP23298 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PrkchP23298 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PrkchP23298 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PrkchP23298 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PrkchP23298 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PrkchP23298 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PrkchP23298 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PrkchP23298 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PrkchP23298 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PrkchP23298 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PrkchP23298 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PrkchP23298 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PrkchP23298 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PrkchP23298 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PrkchP23298 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PrkchP23298 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PrkchP23298 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PrkchP23298 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PrkchP23298 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PrkchP23298 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PrkchP23298 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PrkchP23298 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PrkchP23298 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PrkchP23298 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PrkchP23298 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PrkchP23298 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PrkchP23298 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PrkchP23298 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PrkchP23298 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PrkchP23298 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PrkchP23298 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PrkchP23298 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms