Protein–RNA interactions for Protein: P21278

Gna11, Guanine nucleotide-binding protein subunit alpha-11, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gna11P21278 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Gna11P21278 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gna11P21278 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gna11P21278 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gna11P21278 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gna11P21278 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gna11P21278 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gna11P21278 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gna11P21278 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gna11P21278 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gna11P21278 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gna11P21278 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gna11P21278 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gna11P21278 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gna11P21278 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gna11P21278 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gna11P21278 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gna11P21278 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gna11P21278 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gna11P21278 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Gna11P21278 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gna11P21278 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gna11P21278 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gna11P21278 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gna11P21278 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gna11P21278 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gna11P21278 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gna11P21278 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gna11P21278 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gna11P21278 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gna11P21278 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gna11P21278 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gna11P21278 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Gna11P21278 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gna11P21278 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gna11P21278 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gna11P21278 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gna11P21278 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gna11P21278 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gna11P21278 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gna11P21278 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gna11P21278 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gna11P21278 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gna11P21278 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gna11P21278 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gna11P21278 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Gna11P21278 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gna11P21278 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gna11P21278 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gna11P21278 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gna11P21278 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gna11P21278 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gna11P21278 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gna11P21278 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gna11P21278 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gna11P21278 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gna11P21278 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gna11P21278 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gna11P21278 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gna11P21278 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gna11P21278 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gna11P21278 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gna11P21278 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gna11P21278 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gna11P21278 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gna11P21278 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gna11P21278 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gna11P21278 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gna11P21278 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gna11P21278 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gna11P21278 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gna11P21278 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gna11P21278 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gna11P21278 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Gna11P21278 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gna11P21278 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gna11P21278 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gna11P21278 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gna11P21278 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gna11P21278 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gna11P21278 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Gna11P21278 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gna11P21278 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gna11P21278 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gna11P21278 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gna11P21278 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gna11P21278 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Gna11P21278 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gna11P21278 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Gna11P21278 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Gna11P21278 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gna11P21278 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gna11P21278 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gna11P21278 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gna11P21278 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gna11P21278 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Gna11P21278 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gna11P21278 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gna11P21278 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gna11P21278 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms