Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PrkcaP20444 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PrkcaP20444 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PrkcaP20444 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PrkcaP20444 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PrkcaP20444 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PrkcaP20444 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PrkcaP20444 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PrkcaP20444 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PrkcaP20444 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PrkcaP20444 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PrkcaP20444 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PrkcaP20444 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PrkcaP20444 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PrkcaP20444 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PrkcaP20444 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PrkcaP20444 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PrkcaP20444 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PrkcaP20444 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PrkcaP20444 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PrkcaP20444 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PrkcaP20444 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PrkcaP20444 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PrkcaP20444 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PrkcaP20444 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PrkcaP20444 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PrkcaP20444 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PrkcaP20444 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PrkcaP20444 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PrkcaP20444 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PrkcaP20444 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PrkcaP20444 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PrkcaP20444 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PrkcaP20444 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PrkcaP20444 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PrkcaP20444 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PrkcaP20444 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PrkcaP20444 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PrkcaP20444 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PrkcaP20444 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PrkcaP20444 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PrkcaP20444 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PrkcaP20444 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PrkcaP20444 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PrkcaP20444 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PrkcaP20444 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PrkcaP20444 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PrkcaP20444 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PrkcaP20444 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PrkcaP20444 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PrkcaP20444 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PrkcaP20444 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PrkcaP20444 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PrkcaP20444 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PrkcaP20444 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PrkcaP20444 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PrkcaP20444 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PrkcaP20444 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PrkcaP20444 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PrkcaP20444 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PrkcaP20444 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PrkcaP20444 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PrkcaP20444 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PrkcaP20444 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PrkcaP20444 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PrkcaP20444 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PrkcaP20444 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PrkcaP20444 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PrkcaP20444 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PrkcaP20444 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PrkcaP20444 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PrkcaP20444 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PrkcaP20444 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PrkcaP20444 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PrkcaP20444 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PrkcaP20444 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PrkcaP20444 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PrkcaP20444 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PrkcaP20444 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PrkcaP20444 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PrkcaP20444 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PrkcaP20444 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PrkcaP20444 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PrkcaP20444 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PrkcaP20444 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PrkcaP20444 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PrkcaP20444 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PrkcaP20444 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PrkcaP20444 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PrkcaP20444 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PrkcaP20444 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PrkcaP20444 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PrkcaP20444 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PrkcaP20444 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PrkcaP20444 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PrkcaP20444 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PrkcaP20444 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PrkcaP20444 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PrkcaP20444 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PrkcaP20444 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms