Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PdgfaP20033 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PdgfaP20033 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PdgfaP20033 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PdgfaP20033 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PdgfaP20033 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PdgfaP20033 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PdgfaP20033 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PdgfaP20033 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PdgfaP20033 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PdgfaP20033 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PdgfaP20033 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PdgfaP20033 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PdgfaP20033 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PdgfaP20033 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PdgfaP20033 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PdgfaP20033 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PdgfaP20033 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PdgfaP20033 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PdgfaP20033 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PdgfaP20033 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PdgfaP20033 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PdgfaP20033 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PdgfaP20033 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PdgfaP20033 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PdgfaP20033 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PdgfaP20033 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PdgfaP20033 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PdgfaP20033 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PdgfaP20033 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PdgfaP20033 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PdgfaP20033 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PdgfaP20033 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PdgfaP20033 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PdgfaP20033 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PdgfaP20033 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PdgfaP20033 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PdgfaP20033 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PdgfaP20033 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PdgfaP20033 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PdgfaP20033 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PdgfaP20033 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PdgfaP20033 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PdgfaP20033 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PdgfaP20033 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PdgfaP20033 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PdgfaP20033 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PdgfaP20033 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PdgfaP20033 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PdgfaP20033 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PdgfaP20033 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PdgfaP20033 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PdgfaP20033 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PdgfaP20033 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PdgfaP20033 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
PdgfaP20033 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PdgfaP20033 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PdgfaP20033 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PdgfaP20033 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PdgfaP20033 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PdgfaP20033 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PdgfaP20033 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
PdgfaP20033 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PdgfaP20033 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
PdgfaP20033 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PdgfaP20033 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PdgfaP20033 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PdgfaP20033 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PdgfaP20033 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PdgfaP20033 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PdgfaP20033 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PdgfaP20033 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PdgfaP20033 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PdgfaP20033 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PdgfaP20033 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PdgfaP20033 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PdgfaP20033 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PdgfaP20033 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PdgfaP20033 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PdgfaP20033 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PdgfaP20033 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PdgfaP20033 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PdgfaP20033 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PdgfaP20033 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PdgfaP20033 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PdgfaP20033 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PdgfaP20033 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PdgfaP20033 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PdgfaP20033 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PdgfaP20033 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PdgfaP20033 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PdgfaP20033 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PdgfaP20033 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PdgfaP20033 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PdgfaP20033 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PdgfaP20033 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PdgfaP20033 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PdgfaP20033 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PdgfaP20033 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PdgfaP20033 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms