Protein–RNA interactions for Protein: P19253

Rpl13a, 60S ribosomal protein L13a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 203 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl13aP19253 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpl13aP19253 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpl13aP19253 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpl13aP19253 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpl13aP19253 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpl13aP19253 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpl13aP19253 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpl13aP19253 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpl13aP19253 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpl13aP19253 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpl13aP19253 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpl13aP19253 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpl13aP19253 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpl13aP19253 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpl13aP19253 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpl13aP19253 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpl13aP19253 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpl13aP19253 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpl13aP19253 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpl13aP19253 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpl13aP19253 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpl13aP19253 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpl13aP19253 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpl13aP19253 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpl13aP19253 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpl13aP19253 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpl13aP19253 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpl13aP19253 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpl13aP19253 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpl13aP19253 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpl13aP19253 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpl13aP19253 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpl13aP19253 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpl13aP19253 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpl13aP19253 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpl13aP19253 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpl13aP19253 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpl13aP19253 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpl13aP19253 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpl13aP19253 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpl13aP19253 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpl13aP19253 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpl13aP19253 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpl13aP19253 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpl13aP19253 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpl13aP19253 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpl13aP19253 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpl13aP19253 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Rpl13aP19253 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rpl13aP19253 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rpl13aP19253 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rpl13aP19253 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rpl13aP19253 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rpl13aP19253 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rpl13aP19253 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rpl13aP19253 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rpl13aP19253 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rpl13aP19253 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rpl13aP19253 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rpl13aP19253 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rpl13aP19253 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rpl13aP19253 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rpl13aP19253 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rpl13aP19253 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rpl13aP19253 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rpl13aP19253 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rpl13aP19253 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rpl13aP19253 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rpl13aP19253 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rpl13aP19253 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rpl13aP19253 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rpl13aP19253 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpl13aP19253 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpl13aP19253 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpl13aP19253 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpl13aP19253 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpl13aP19253 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpl13aP19253 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpl13aP19253 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpl13aP19253 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpl13aP19253 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpl13aP19253 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpl13aP19253 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpl13aP19253 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpl13aP19253 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpl13aP19253 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpl13aP19253 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpl13aP19253 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpl13aP19253 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpl13aP19253 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpl13aP19253 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpl13aP19253 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpl13aP19253 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpl13aP19253 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpl13aP19253 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpl13aP19253 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpl13aP19253 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpl13aP19253 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpl13aP19253 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpl13aP19253 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
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