Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxb1P17919 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxb1P17919 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxb1P17919 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxb1P17919 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxb1P17919 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxb1P17919 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxb1P17919 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxb1P17919 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxb1P17919 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxb1P17919 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxb1P17919 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxb1P17919 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxb1P17919 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxb1P17919 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxb1P17919 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxb1P17919 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxb1P17919 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxb1P17919 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxb1P17919 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxb1P17919 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxb1P17919 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxb1P17919 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxb1P17919 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxb1P17919 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxb1P17919 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxb1P17919 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxb1P17919 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxb1P17919 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxb1P17919 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxb1P17919 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxb1P17919 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxb1P17919 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxb1P17919 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxb1P17919 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxb1P17919 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxb1P17919 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxb1P17919 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxb1P17919 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxb1P17919 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxb1P17919 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxb1P17919 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxb1P17919 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxb1P17919 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxb1P17919 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxb1P17919 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxb1P17919 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxb1P17919 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxb1P17919 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxb1P17919 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxb1P17919 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxb1P17919 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxb1P17919 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxb1P17919 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxb1P17919 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxb1P17919 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxb1P17919 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxb1P17919 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxb1P17919 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxb1P17919 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxb1P17919 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxb1P17919 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxb1P17919 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxb1P17919 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxb1P17919 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxb1P17919 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxb1P17919 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxb1P17919 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxb1P17919 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxb1P17919 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxb1P17919 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxb1P17919 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxb1P17919 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxb1P17919 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxb1P17919 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxb1P17919 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxb1P17919 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxb1P17919 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxb1P17919 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxb1P17919 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxb1P17919 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxb1P17919 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxb1P17919 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxb1P17919 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxb1P17919 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxb1P17919 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxb1P17919 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxb1P17919 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxb1P17919 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxb1P17919 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxb1P17919 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxb1P17919 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxb1P17919 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxb1P17919 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxb1P17919 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxb1P17919 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxb1P17919 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hoxb1P17919 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hoxb1P17919 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hoxb1P17919 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.9 ms