Protein–RNA interactions for Protein: P12850

Cxcl1, Growth-regulated alpha protein, mousemouse

Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl1P12850 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cxcl1P12850 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cxcl1P12850 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cxcl1P12850 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cxcl1P12850 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cxcl1P12850 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cxcl1P12850 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cxcl1P12850 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cxcl1P12850 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cxcl1P12850 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cxcl1P12850 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cxcl1P12850 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cxcl1P12850 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cxcl1P12850 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cxcl1P12850 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cxcl1P12850 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cxcl1P12850 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cxcl1P12850 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cxcl1P12850 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cxcl1P12850 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cxcl1P12850 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cxcl1P12850 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cxcl1P12850 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cxcl1P12850 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cxcl1P12850 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cxcl1P12850 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cxcl1P12850 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cxcl1P12850 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cxcl1P12850 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cxcl1P12850 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cxcl1P12850 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cxcl1P12850 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cxcl1P12850 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cxcl1P12850 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cxcl1P12850 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cxcl1P12850 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cxcl1P12850 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cxcl1P12850 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cxcl1P12850 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cxcl1P12850 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cxcl1P12850 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cxcl1P12850 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cxcl1P12850 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cxcl1P12850 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cxcl1P12850 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cxcl1P12850 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cxcl1P12850 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cxcl1P12850 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cxcl1P12850 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cxcl1P12850 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cxcl1P12850 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cxcl1P12850 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cxcl1P12850 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cxcl1P12850 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cxcl1P12850 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cxcl1P12850 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cxcl1P12850 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cxcl1P12850 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cxcl1P12850 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cxcl1P12850 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cxcl1P12850 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cxcl1P12850 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cxcl1P12850 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cxcl1P12850 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cxcl1P12850 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cxcl1P12850 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cxcl1P12850 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cxcl1P12850 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cxcl1P12850 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cxcl1P12850 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cxcl1P12850 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cxcl1P12850 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cxcl1P12850 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cxcl1P12850 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cxcl1P12850 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cxcl1P12850 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cxcl1P12850 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cxcl1P12850 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cxcl1P12850 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cxcl1P12850 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cxcl1P12850 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cxcl1P12850 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cxcl1P12850 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cxcl1P12850 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cxcl1P12850 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cxcl1P12850 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cxcl1P12850 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cxcl1P12850 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cxcl1P12850 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cxcl1P12850 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cxcl1P12850 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cxcl1P12850 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cxcl1P12850 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cxcl1P12850 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cxcl1P12850 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cxcl1P12850 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cxcl1P12850 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cxcl1P12850 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cxcl1P12850 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cxcl1P12850 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms