Protein–RNA interactions for Protein: P12813

Nr4a1, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr4a1P12813 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nr4a1P12813 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nr4a1P12813 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nr4a1P12813 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nr4a1P12813 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nr4a1P12813 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nr4a1P12813 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nr4a1P12813 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nr4a1P12813 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nr4a1P12813 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nr4a1P12813 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nr4a1P12813 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nr4a1P12813 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nr4a1P12813 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nr4a1P12813 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nr4a1P12813 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nr4a1P12813 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nr4a1P12813 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nr4a1P12813 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nr4a1P12813 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nr4a1P12813 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nr4a1P12813 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nr4a1P12813 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nr4a1P12813 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nr4a1P12813 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nr4a1P12813 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nr4a1P12813 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nr4a1P12813 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nr4a1P12813 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nr4a1P12813 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nr4a1P12813 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nr4a1P12813 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nr4a1P12813 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nr4a1P12813 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Nr4a1P12813 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Nr4a1P12813 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Nr4a1P12813 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Nr4a1P12813 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nr4a1P12813 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nr4a1P12813 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nr4a1P12813 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nr4a1P12813 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nr4a1P12813 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nr4a1P12813 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nr4a1P12813 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nr4a1P12813 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nr4a1P12813 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nr4a1P12813 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nr4a1P12813 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nr4a1P12813 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nr4a1P12813 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nr4a1P12813 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nr4a1P12813 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nr4a1P12813 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nr4a1P12813 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nr4a1P12813 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nr4a1P12813 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nr4a1P12813 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nr4a1P12813 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nr4a1P12813 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nr4a1P12813 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nr4a1P12813 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nr4a1P12813 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nr4a1P12813 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nr4a1P12813 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nr4a1P12813 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nr4a1P12813 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nr4a1P12813 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nr4a1P12813 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nr4a1P12813 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nr4a1P12813 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nr4a1P12813 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nr4a1P12813 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nr4a1P12813 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nr4a1P12813 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nr4a1P12813 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nr4a1P12813 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nr4a1P12813 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nr4a1P12813 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nr4a1P12813 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nr4a1P12813 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nr4a1P12813 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Nr4a1P12813 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Nr4a1P12813 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nr4a1P12813 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nr4a1P12813 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nr4a1P12813 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nr4a1P12813 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Nr4a1P12813 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nr4a1P12813 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nr4a1P12813 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nr4a1P12813 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nr4a1P12813 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nr4a1P12813 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nr4a1P12813 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nr4a1P12813 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nr4a1P12813 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nr4a1P12813 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nr4a1P12813 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nr4a1P12813 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms