Protein–RNA interactions for Protein: P11609

Cd1d1, Antigen-presenting glycoprotein CD1d1, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd1d1P11609 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd1d1P11609 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd1d1P11609 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd1d1P11609 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd1d1P11609 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd1d1P11609 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd1d1P11609 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd1d1P11609 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd1d1P11609 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd1d1P11609 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd1d1P11609 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd1d1P11609 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd1d1P11609 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd1d1P11609 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd1d1P11609 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cd1d1P11609 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cd1d1P11609 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cd1d1P11609 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cd1d1P11609 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cd1d1P11609 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cd1d1P11609 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cd1d1P11609 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cd1d1P11609 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cd1d1P11609 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cd1d1P11609 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cd1d1P11609 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cd1d1P11609 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cd1d1P11609 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cd1d1P11609 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cd1d1P11609 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cd1d1P11609 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cd1d1P11609 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cd1d1P11609 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cd1d1P11609 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cd1d1P11609 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd1d1P11609 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd1d1P11609 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd1d1P11609 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd1d1P11609 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd1d1P11609 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd1d1P11609 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd1d1P11609 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd1d1P11609 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd1d1P11609 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd1d1P11609 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd1d1P11609 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd1d1P11609 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd1d1P11609 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd1d1P11609 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd1d1P11609 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd1d1P11609 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd1d1P11609 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd1d1P11609 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd1d1P11609 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd1d1P11609 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd1d1P11609 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd1d1P11609 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd1d1P11609 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd1d1P11609 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd1d1P11609 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd1d1P11609 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd1d1P11609 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd1d1P11609 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd1d1P11609 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd1d1P11609 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd1d1P11609 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd1d1P11609 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cd1d1P11609 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cd1d1P11609 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cd1d1P11609 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cd1d1P11609 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cd1d1P11609 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cd1d1P11609 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cd1d1P11609 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Cd1d1P11609 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cd1d1P11609 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cd1d1P11609 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cd1d1P11609 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cd1d1P11609 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cd1d1P11609 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cd1d1P11609 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cd1d1P11609 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cd1d1P11609 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cd1d1P11609 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cd1d1P11609 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cd1d1P11609 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Cd1d1P11609 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cd1d1P11609 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cd1d1P11609 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cd1d1P11609 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cd1d1P11609 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cd1d1P11609 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cd1d1P11609 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cd1d1P11609 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cd1d1P11609 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cd1d1P11609 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cd1d1P11609 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cd1d1P11609 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cd1d1P11609 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Cd1d1P11609 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms