Protein–RNA interactions for Protein: P11260

Lire1, LINE-1 retrotransposable element ORF1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lire1P11260 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lire1P11260 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lire1P11260 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lire1P11260 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lire1P11260 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lire1P11260 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lire1P11260 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lire1P11260 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lire1P11260 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lire1P11260 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lire1P11260 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lire1P11260 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lire1P11260 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lire1P11260 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lire1P11260 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Lire1P11260 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lire1P11260 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lire1P11260 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lire1P11260 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lire1P11260 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lire1P11260 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lire1P11260 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lire1P11260 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lire1P11260 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lire1P11260 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lire1P11260 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lire1P11260 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lire1P11260 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lire1P11260 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lire1P11260 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lire1P11260 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lire1P11260 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Lire1P11260 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lire1P11260 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lire1P11260 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lire1P11260 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lire1P11260 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lire1P11260 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lire1P11260 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lire1P11260 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lire1P11260 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Lire1P11260 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lire1P11260 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lire1P11260 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lire1P11260 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lire1P11260 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lire1P11260 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lire1P11260 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lire1P11260 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lire1P11260 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lire1P11260 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lire1P11260 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lire1P11260 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lire1P11260 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lire1P11260 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lire1P11260 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lire1P11260 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lire1P11260 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lire1P11260 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Lire1P11260 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lire1P11260 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lire1P11260 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lire1P11260 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lire1P11260 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lire1P11260 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lire1P11260 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lire1P11260 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lire1P11260 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lire1P11260 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lire1P11260 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lire1P11260 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lire1P11260 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lire1P11260 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lire1P11260 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lire1P11260 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lire1P11260 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lire1P11260 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lire1P11260 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lire1P11260 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lire1P11260 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lire1P11260 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lire1P11260 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lire1P11260 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lire1P11260 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lire1P11260 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lire1P11260 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lire1P11260 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lire1P11260 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lire1P11260 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lire1P11260 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lire1P11260 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Lire1P11260 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Lire1P11260 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lire1P11260 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lire1P11260 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lire1P11260 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lire1P11260 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lire1P11260 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Lire1P11260 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lire1P11260 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms