Protein–RNA interactions for Protein: P11103

Parp1, Poly [ADP-ribose] polymerase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp1P11103 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Parp1P11103 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Parp1P11103 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Parp1P11103 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Parp1P11103 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Parp1P11103 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Parp1P11103 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Parp1P11103 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Parp1P11103 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Parp1P11103 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Parp1P11103 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Parp1P11103 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Parp1P11103 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Parp1P11103 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Parp1P11103 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Parp1P11103 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Parp1P11103 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Parp1P11103 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Parp1P11103 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Parp1P11103 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Parp1P11103 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Parp1P11103 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Parp1P11103 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Parp1P11103 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Parp1P11103 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Parp1P11103 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Parp1P11103 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Parp1P11103 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Parp1P11103 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Parp1P11103 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Parp1P11103 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Parp1P11103 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Parp1P11103 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Parp1P11103 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Parp1P11103 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Parp1P11103 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Parp1P11103 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Parp1P11103 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Parp1P11103 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Parp1P11103 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Parp1P11103 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Parp1P11103 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Parp1P11103 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Parp1P11103 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Parp1P11103 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Parp1P11103 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Parp1P11103 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Parp1P11103 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Parp1P11103 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Parp1P11103 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Parp1P11103 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Parp1P11103 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Parp1P11103 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Parp1P11103 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Parp1P11103 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Parp1P11103 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Parp1P11103 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Parp1P11103 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Parp1P11103 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Parp1P11103 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Parp1P11103 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Parp1P11103 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Parp1P11103 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Parp1P11103 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Parp1P11103 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Parp1P11103 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Parp1P11103 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Parp1P11103 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Parp1P11103 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Parp1P11103 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Parp1P11103 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Parp1P11103 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Parp1P11103 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Parp1P11103 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Parp1P11103 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Parp1P11103 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Parp1P11103 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Parp1P11103 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Parp1P11103 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Parp1P11103 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Parp1P11103 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Parp1P11103 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Parp1P11103 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Parp1P11103 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Parp1P11103 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Parp1P11103 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Parp1P11103 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Parp1P11103 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Parp1P11103 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Parp1P11103 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Parp1P11103 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Parp1P11103 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Parp1P11103 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Parp1P11103 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Parp1P11103 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Parp1P11103 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Parp1P11103 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Parp1P11103 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Parp1P11103 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Parp1P11103 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms