Protein–RNA interactions for Protein: P10923

Spp1, Osteopontin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spp1P10923 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Spp1P10923 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Spp1P10923 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Spp1P10923 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Spp1P10923 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Spp1P10923 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Spp1P10923 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Spp1P10923 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Spp1P10923 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Spp1P10923 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Spp1P10923 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Spp1P10923 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Spp1P10923 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Spp1P10923 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Spp1P10923 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Spp1P10923 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Spp1P10923 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Spp1P10923 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Spp1P10923 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Spp1P10923 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Spp1P10923 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Spp1P10923 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Spp1P10923 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Spp1P10923 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Spp1P10923 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Spp1P10923 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Spp1P10923 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Spp1P10923 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Spp1P10923 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Spp1P10923 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Spp1P10923 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Spp1P10923 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Spp1P10923 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Spp1P10923 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Spp1P10923 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Spp1P10923 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Spp1P10923 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Spp1P10923 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Spp1P10923 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Spp1P10923 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Spp1P10923 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Spp1P10923 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Spp1P10923 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Spp1P10923 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Spp1P10923 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Spp1P10923 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Spp1P10923 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Spp1P10923 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Spp1P10923 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Spp1P10923 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Spp1P10923 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Spp1P10923 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Spp1P10923 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Spp1P10923 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Spp1P10923 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Spp1P10923 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Spp1P10923 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Spp1P10923 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Spp1P10923 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Spp1P10923 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Spp1P10923 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Spp1P10923 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Spp1P10923 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Spp1P10923 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Spp1P10923 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Spp1P10923 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Spp1P10923 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Spp1P10923 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Spp1P10923 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Spp1P10923 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Spp1P10923 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Spp1P10923 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Spp1P10923 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Spp1P10923 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Spp1P10923 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Spp1P10923 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Spp1P10923 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Spp1P10923 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Spp1P10923 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Spp1P10923 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Spp1P10923 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Spp1P10923 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Spp1P10923 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Spp1P10923 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Spp1P10923 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Spp1P10923 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Spp1P10923 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Spp1P10923 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Spp1P10923 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Spp1P10923 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Spp1P10923 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Spp1P10923 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Spp1P10923 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Spp1P10923 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Spp1P10923 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Spp1P10923 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Spp1P10923 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Spp1P10923 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Spp1P10923 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Spp1P10923 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms