Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxd4P10628 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxd4P10628 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxd4P10628 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxd4P10628 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxd4P10628 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxd4P10628 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxd4P10628 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxd4P10628 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxd4P10628 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxd4P10628 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxd4P10628 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxd4P10628 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxd4P10628 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxd4P10628 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxd4P10628 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxd4P10628 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxd4P10628 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxd4P10628 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxd4P10628 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxd4P10628 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxd4P10628 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxd4P10628 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxd4P10628 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxd4P10628 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxd4P10628 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxd4P10628 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxd4P10628 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxd4P10628 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxd4P10628 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxd4P10628 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxd4P10628 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxd4P10628 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxd4P10628 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxd4P10628 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxd4P10628 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxd4P10628 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxd4P10628 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxd4P10628 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxd4P10628 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxd4P10628 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxd4P10628 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxd4P10628 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxd4P10628 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxd4P10628 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxd4P10628 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hoxd4P10628 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hoxd4P10628 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hoxd4P10628 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxd4P10628 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxd4P10628 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxd4P10628 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxd4P10628 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxd4P10628 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxd4P10628 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxd4P10628 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxd4P10628 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxd4P10628 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxd4P10628 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxd4P10628 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxd4P10628 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxd4P10628 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxd4P10628 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxd4P10628 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxd4P10628 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxd4P10628 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxd4P10628 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxd4P10628 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxd4P10628 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxd4P10628 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxd4P10628 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxd4P10628 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxd4P10628 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxd4P10628 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxd4P10628 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxd4P10628 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxd4P10628 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxd4P10628 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxd4P10628 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxd4P10628 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxd4P10628 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxd4P10628 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxd4P10628 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxd4P10628 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxd4P10628 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxd4P10628 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxd4P10628 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxd4P10628 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxd4P10628 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxd4P10628 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxd4P10628 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxd4P10628 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxd4P10628 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxd4P10628 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxd4P10628 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxd4P10628 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxd4P10628 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxd4P10628 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxd4P10628 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxd4P10628 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms