Protein–RNA interactions for Protein: P0DN34

Ndufb1, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 57 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb1P0DN34 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ndufb1P0DN34 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ndufb1P0DN34 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ndufb1P0DN34 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ndufb1P0DN34 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ndufb1P0DN34 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ndufb1P0DN34 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ndufb1P0DN34 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ndufb1P0DN34 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ndufb1P0DN34 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Ndufb1P0DN34 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ndufb1P0DN34 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ndufb1P0DN34 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ndufb1P0DN34 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ndufb1P0DN34 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ndufb1P0DN34 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ndufb1P0DN34 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ndufb1P0DN34 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ndufb1P0DN34 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ndufb1P0DN34 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ndufb1P0DN34 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ndufb1P0DN34 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Ndufb1P0DN34 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ndufb1P0DN34 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ndufb1P0DN34 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ndufb1P0DN34 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ndufb1P0DN34 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ndufb1P0DN34 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ndufb1P0DN34 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ndufb1P0DN34 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Ndufb1P0DN34 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Ndufb1P0DN34 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ndufb1P0DN34 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ndufb1P0DN34 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ndufb1P0DN34 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ndufb1P0DN34 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ndufb1P0DN34 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ndufb1P0DN34 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ndufb1P0DN34 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ndufb1P0DN34 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ndufb1P0DN34 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ndufb1P0DN34 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ndufb1P0DN34 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ndufb1P0DN34 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Ndufb1P0DN34 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ndufb1P0DN34 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ndufb1P0DN34 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ndufb1P0DN34 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ndufb1P0DN34 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ndufb1P0DN34 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ndufb1P0DN34 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ndufb1P0DN34 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ndufb1P0DN34 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ndufb1P0DN34 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ndufb1P0DN34 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ndufb1P0DN34 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ndufb1P0DN34 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ndufb1P0DN34 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ndufb1P0DN34 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ndufb1P0DN34 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ndufb1P0DN34 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ndufb1P0DN34 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ndufb1P0DN34 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ndufb1P0DN34 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ndufb1P0DN34 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ndufb1P0DN34 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ndufb1P0DN34 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ndufb1P0DN34 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ndufb1P0DN34 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ndufb1P0DN34 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ndufb1P0DN34 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ndufb1P0DN34 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ndufb1P0DN34 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ndufb1P0DN34 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ndufb1P0DN34 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ndufb1P0DN34 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ndufb1P0DN34 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ndufb1P0DN34 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ndufb1P0DN34 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ndufb1P0DN34 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ndufb1P0DN34 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ndufb1P0DN34 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ndufb1P0DN34 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ndufb1P0DN34 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ndufb1P0DN34 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ndufb1P0DN34 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ndufb1P0DN34 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ndufb1P0DN34 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ndufb1P0DN34 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ndufb1P0DN34 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ndufb1P0DN34 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ndufb1P0DN34 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ndufb1P0DN34 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ndufb1P0DN34 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ndufb1P0DN34 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ndufb1P0DN34 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
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Ndufb1P0DN34 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ndufb1P0DN34 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ndufb1P0DN34 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms